Protein–RNA interactions for Protein: Q60664

Lrmp, Lymphoid-restricted membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LrmpQ60664 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LrmpQ60664 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LrmpQ60664 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LrmpQ60664 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LrmpQ60664 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LrmpQ60664 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LrmpQ60664 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LrmpQ60664 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LrmpQ60664 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LrmpQ60664 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LrmpQ60664 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LrmpQ60664 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LrmpQ60664 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LrmpQ60664 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LrmpQ60664 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LrmpQ60664 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LrmpQ60664 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LrmpQ60664 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LrmpQ60664 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LrmpQ60664 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LrmpQ60664 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LrmpQ60664 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LrmpQ60664 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LrmpQ60664 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LrmpQ60664 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LrmpQ60664 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LrmpQ60664 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LrmpQ60664 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LrmpQ60664 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LrmpQ60664 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LrmpQ60664 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LrmpQ60664 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LrmpQ60664 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LrmpQ60664 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LrmpQ60664 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LrmpQ60664 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LrmpQ60664 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LrmpQ60664 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LrmpQ60664 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LrmpQ60664 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LrmpQ60664 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LrmpQ60664 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LrmpQ60664 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LrmpQ60664 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LrmpQ60664 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LrmpQ60664 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LrmpQ60664 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LrmpQ60664 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LrmpQ60664 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LrmpQ60664 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LrmpQ60664 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LrmpQ60664 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LrmpQ60664 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LrmpQ60664 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LrmpQ60664 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LrmpQ60664 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LrmpQ60664 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LrmpQ60664 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LrmpQ60664 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LrmpQ60664 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LrmpQ60664 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LrmpQ60664 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LrmpQ60664 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LrmpQ60664 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LrmpQ60664 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LrmpQ60664 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LrmpQ60664 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LrmpQ60664 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LrmpQ60664 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LrmpQ60664 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LrmpQ60664 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LrmpQ60664 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LrmpQ60664 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LrmpQ60664 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LrmpQ60664 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LrmpQ60664 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LrmpQ60664 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LrmpQ60664 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LrmpQ60664 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LrmpQ60664 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LrmpQ60664 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LrmpQ60664 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LrmpQ60664 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LrmpQ60664 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LrmpQ60664 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LrmpQ60664 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LrmpQ60664 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LrmpQ60664 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LrmpQ60664 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LrmpQ60664 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LrmpQ60664 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LrmpQ60664 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LrmpQ60664 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LrmpQ60664 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LrmpQ60664 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LrmpQ60664 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LrmpQ60664 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LrmpQ60664 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LrmpQ60664 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LrmpQ60664 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms