Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sema5bQ60519 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sema5bQ60519 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Sema5bQ60519 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sema5bQ60519 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sema5bQ60519 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sema5bQ60519 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sema5bQ60519 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sema5bQ60519 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sema5bQ60519 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sema5bQ60519 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema5bQ60519 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema5bQ60519 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema5bQ60519 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema5bQ60519 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema5bQ60519 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sema5bQ60519 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sema5bQ60519 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sema5bQ60519 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Sema5bQ60519 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema5bQ60519 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema5bQ60519 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema5bQ60519 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sema5bQ60519 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sema5bQ60519 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sema5bQ60519 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sema5bQ60519 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sema5bQ60519 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sema5bQ60519 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sema5bQ60519 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sema5bQ60519 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sema5bQ60519 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sema5bQ60519 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sema5bQ60519 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema5bQ60519 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema5bQ60519 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema5bQ60519 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema5bQ60519 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sema5bQ60519 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sema5bQ60519 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sema5bQ60519 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sema5bQ60519 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sema5bQ60519 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sema5bQ60519 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sema5bQ60519 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema5bQ60519 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema5bQ60519 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Sema5bQ60519 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sema5bQ60519 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema5bQ60519 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema5bQ60519 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema5bQ60519 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema5bQ60519 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema5bQ60519 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema5bQ60519 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema5bQ60519 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema5bQ60519 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema5bQ60519 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema5bQ60519 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema5bQ60519 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema5bQ60519 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema5bQ60519 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema5bQ60519 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema5bQ60519 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema5bQ60519 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema5bQ60519 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema5bQ60519 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema5bQ60519 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema5bQ60519 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema5bQ60519 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema5bQ60519 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema5bQ60519 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema5bQ60519 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema5bQ60519 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema5bQ60519 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sema5bQ60519 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sema5bQ60519 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema5bQ60519 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema5bQ60519 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema5bQ60519 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema5bQ60519 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema5bQ60519 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema5bQ60519 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sema5bQ60519 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sema5bQ60519 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sema5bQ60519 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sema5bQ60519 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Sema5bQ60519 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sema5bQ60519 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Sema5bQ60519 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sema5bQ60519 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sema5bQ60519 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sema5bQ60519 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sema5bQ60519 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sema5bQ60519 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sema5bQ60519 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sema5bQ60519 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sema5bQ60519 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sema5bQ60519 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sema5bQ60519 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms