Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW19

Cluh, Clustered mitochondria protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluhQ5SW19 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CluhQ5SW19 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CluhQ5SW19 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CluhQ5SW19 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CluhQ5SW19 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CluhQ5SW19 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CluhQ5SW19 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CluhQ5SW19 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CluhQ5SW19 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CluhQ5SW19 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CluhQ5SW19 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CluhQ5SW19 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CluhQ5SW19 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CluhQ5SW19 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CluhQ5SW19 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CluhQ5SW19 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CluhQ5SW19 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CluhQ5SW19 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CluhQ5SW19 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CluhQ5SW19 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CluhQ5SW19 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CluhQ5SW19 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CluhQ5SW19 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CluhQ5SW19 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CluhQ5SW19 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CluhQ5SW19 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CluhQ5SW19 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CluhQ5SW19 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CluhQ5SW19 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CluhQ5SW19 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CluhQ5SW19 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CluhQ5SW19 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CluhQ5SW19 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CluhQ5SW19 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CluhQ5SW19 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CluhQ5SW19 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CluhQ5SW19 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CluhQ5SW19 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CluhQ5SW19 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CluhQ5SW19 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CluhQ5SW19 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CluhQ5SW19 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CluhQ5SW19 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CluhQ5SW19 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CluhQ5SW19 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CluhQ5SW19 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CluhQ5SW19 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CluhQ5SW19 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CluhQ5SW19 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CluhQ5SW19 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CluhQ5SW19 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CluhQ5SW19 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CluhQ5SW19 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CluhQ5SW19 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CluhQ5SW19 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CluhQ5SW19 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CluhQ5SW19 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CluhQ5SW19 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CluhQ5SW19 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CluhQ5SW19 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CluhQ5SW19 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CluhQ5SW19 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CluhQ5SW19 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CluhQ5SW19 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CluhQ5SW19 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CluhQ5SW19 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CluhQ5SW19 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CluhQ5SW19 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CluhQ5SW19 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CluhQ5SW19 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CluhQ5SW19 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CluhQ5SW19 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CluhQ5SW19 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CluhQ5SW19 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CluhQ5SW19 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CluhQ5SW19 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CluhQ5SW19 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CluhQ5SW19 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CluhQ5SW19 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CluhQ5SW19 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CluhQ5SW19 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CluhQ5SW19 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CluhQ5SW19 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CluhQ5SW19 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CluhQ5SW19 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CluhQ5SW19 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CluhQ5SW19 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CluhQ5SW19 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CluhQ5SW19 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CluhQ5SW19 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CluhQ5SW19 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CluhQ5SW19 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CluhQ5SW19 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CluhQ5SW19 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CluhQ5SW19 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CluhQ5SW19 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CluhQ5SW19 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CluhQ5SW19 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CluhQ5SW19 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CluhQ5SW19 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.2 ms