Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ankrd40Q5SUE8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ankrd40Q5SUE8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ankrd40Q5SUE8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ankrd40Q5SUE8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ankrd40Q5SUE8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ankrd40Q5SUE8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ankrd40Q5SUE8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ankrd40Q5SUE8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ankrd40Q5SUE8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ankrd40Q5SUE8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ankrd40Q5SUE8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ankrd40Q5SUE8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ankrd40Q5SUE8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ankrd40Q5SUE8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ankrd40Q5SUE8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ankrd40Q5SUE8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ankrd40Q5SUE8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ankrd40Q5SUE8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ankrd40Q5SUE8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ankrd40Q5SUE8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ankrd40Q5SUE8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ankrd40Q5SUE8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ankrd40Q5SUE8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ankrd40Q5SUE8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ankrd40Q5SUE8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ankrd40Q5SUE8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ankrd40Q5SUE8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ankrd40Q5SUE8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ankrd40Q5SUE8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ankrd40Q5SUE8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ankrd40Q5SUE8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ankrd40Q5SUE8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ankrd40Q5SUE8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ankrd40Q5SUE8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ankrd40Q5SUE8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ankrd40Q5SUE8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ankrd40Q5SUE8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ankrd40Q5SUE8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ankrd40Q5SUE8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ankrd40Q5SUE8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ankrd40Q5SUE8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ankrd40Q5SUE8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ankrd40Q5SUE8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ankrd40Q5SUE8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ankrd40Q5SUE8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ankrd40Q5SUE8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ankrd40Q5SUE8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ankrd40Q5SUE8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ankrd40Q5SUE8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ankrd40Q5SUE8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ankrd40Q5SUE8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ankrd40Q5SUE8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ankrd40Q5SUE8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ankrd40Q5SUE8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ankrd40Q5SUE8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ankrd40Q5SUE8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ankrd40Q5SUE8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ankrd40Q5SUE8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ankrd40Q5SUE8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ankrd40Q5SUE8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ankrd40Q5SUE8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ankrd40Q5SUE8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ankrd40Q5SUE8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ankrd40Q5SUE8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ankrd40Q5SUE8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ankrd40Q5SUE8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ankrd40Q5SUE8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms