Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bbs12Q5SUD9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bbs12Q5SUD9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bbs12Q5SUD9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bbs12Q5SUD9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bbs12Q5SUD9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Bbs12Q5SUD9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bbs12Q5SUD9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bbs12Q5SUD9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bbs12Q5SUD9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bbs12Q5SUD9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bbs12Q5SUD9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bbs12Q5SUD9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bbs12Q5SUD9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Bbs12Q5SUD9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bbs12Q5SUD9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bbs12Q5SUD9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Bbs12Q5SUD9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bbs12Q5SUD9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bbs12Q5SUD9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bbs12Q5SUD9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bbs12Q5SUD9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Bbs12Q5SUD9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bbs12Q5SUD9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bbs12Q5SUD9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bbs12Q5SUD9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bbs12Q5SUD9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bbs12Q5SUD9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bbs12Q5SUD9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bbs12Q5SUD9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Bbs12Q5SUD9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms