Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sco1Q5SUC9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sco1Q5SUC9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sco1Q5SUC9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sco1Q5SUC9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sco1Q5SUC9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sco1Q5SUC9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sco1Q5SUC9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sco1Q5SUC9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sco1Q5SUC9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sco1Q5SUC9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sco1Q5SUC9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sco1Q5SUC9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sco1Q5SUC9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sco1Q5SUC9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sco1Q5SUC9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sco1Q5SUC9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sco1Q5SUC9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sco1Q5SUC9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sco1Q5SUC9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sco1Q5SUC9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sco1Q5SUC9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sco1Q5SUC9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sco1Q5SUC9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sco1Q5SUC9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sco1Q5SUC9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sco1Q5SUC9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sco1Q5SUC9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sco1Q5SUC9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sco1Q5SUC9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sco1Q5SUC9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sco1Q5SUC9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sco1Q5SUC9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sco1Q5SUC9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sco1Q5SUC9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sco1Q5SUC9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sco1Q5SUC9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sco1Q5SUC9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sco1Q5SUC9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sco1Q5SUC9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sco1Q5SUC9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sco1Q5SUC9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sco1Q5SUC9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sco1Q5SUC9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sco1Q5SUC9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sco1Q5SUC9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sco1Q5SUC9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sco1Q5SUC9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sco1Q5SUC9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sco1Q5SUC9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sco1Q5SUC9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sco1Q5SUC9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sco1Q5SUC9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sco1Q5SUC9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sco1Q5SUC9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sco1Q5SUC9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sco1Q5SUC9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sco1Q5SUC9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sco1Q5SUC9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sco1Q5SUC9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sco1Q5SUC9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sco1Q5SUC9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms