Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam71bQ5STT6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam71bQ5STT6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam71bQ5STT6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam71bQ5STT6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam71bQ5STT6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam71bQ5STT6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam71bQ5STT6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam71bQ5STT6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam71bQ5STT6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam71bQ5STT6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam71bQ5STT6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam71bQ5STT6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam71bQ5STT6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam71bQ5STT6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam71bQ5STT6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71bQ5STT6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71bQ5STT6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71bQ5STT6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71bQ5STT6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71bQ5STT6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71bQ5STT6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam71bQ5STT6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam71bQ5STT6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam71bQ5STT6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam71bQ5STT6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam71bQ5STT6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam71bQ5STT6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam71bQ5STT6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam71bQ5STT6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam71bQ5STT6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam71bQ5STT6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam71bQ5STT6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam71bQ5STT6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam71bQ5STT6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam71bQ5STT6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms