Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Utp18Q5SSI6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Utp18Q5SSI6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Utp18Q5SSI6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Utp18Q5SSI6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Utp18Q5SSI6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Utp18Q5SSI6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27,15■■□□□ 1,94
Utp18Q5SSI6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27,14■■□□□ 1,94
Utp18Q5SSI6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Utp18Q5SSI6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Utp18Q5SSI6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27,13■■□□□ 1,93
Utp18Q5SSI6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Utp18Q5SSI6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Utp18Q5SSI6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Utp18Q5SSI6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Utp18Q5SSI6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Utp18Q5SSI6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Utp18Q5SSI6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Utp18Q5SSI6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Utp18Q5SSI6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Utp18Q5SSI6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Utp18Q5SSI6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Utp18Q5SSI6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Utp18Q5SSI6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Utp18Q5SSI6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Utp18Q5SSI6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Utp18Q5SSI6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Utp18Q5SSI6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Utp18Q5SSI6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Utp18Q5SSI6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Utp18Q5SSI6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Utp18Q5SSI6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27,07■■□□□ 1,92
Utp18Q5SSI6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Utp18Q5SSI6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Utp18Q5SSI6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Utp18Q5SSI6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Utp18Q5SSI6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27,05■■□□□ 1,92
Utp18Q5SSI6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Utp18Q5SSI6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Utp18Q5SSI6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Utp18Q5SSI6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Utp18Q5SSI6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Utp18Q5SSI6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Utp18Q5SSI6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Utp18Q5SSI6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Utp18Q5SSI6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Utp18Q5SSI6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Utp18Q5SSI6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Utp18Q5SSI6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Utp18Q5SSI6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Utp18Q5SSI6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Utp18Q5SSI6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Utp18Q5SSI6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Utp18Q5SSI6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Utp18Q5SSI6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Utp18Q5SSI6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Utp18Q5SSI6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Utp18Q5SSI6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Utp18Q5SSI6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Utp18Q5SSI6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Utp18Q5SSI6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Utp18Q5SSI6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Utp18Q5SSI6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Utp18Q5SSI6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Utp18Q5SSI6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26,97■■□□□ 1,91
Utp18Q5SSI6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Utp18Q5SSI6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,91
Utp18Q5SSI6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Utp18Q5SSI6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Utp18Q5SSI6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26,94■■□□□ 1,9
Utp18Q5SSI6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Utp18Q5SSI6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Utp18Q5SSI6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26,91■■□□□ 1,9
Utp18Q5SSI6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Utp18Q5SSI6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Utp18Q5SSI6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Utp18Q5SSI6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Utp18Q5SSI6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Utp18Q5SSI6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Utp18Q5SSI6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Utp18Q5SSI6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Utp18Q5SSI6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Utp18Q5SSI6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Utp18Q5SSI6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Utp18Q5SSI6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Utp18Q5SSI6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Utp18Q5SSI6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Utp18Q5SSI6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Utp18Q5SSI6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26,86■■□□□ 1,89
Utp18Q5SSI6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Utp18Q5SSI6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Utp18Q5SSI6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Utp18Q5SSI6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Utp18Q5SSI6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Utp18Q5SSI6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26,83■■□□□ 1,89
Utp18Q5SSI6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26,83■■□□□ 1,89
Utp18Q5SSI6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Utp18Q5SSI6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,88
Utp18Q5SSI6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Utp18Q5SSI6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms