Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS00

Zdbf2, DBF4-type zinc finger-containing protein 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zdbf2Q5SS00 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zdbf2Q5SS00 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Zdbf2Q5SS00 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zdbf2Q5SS00 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zdbf2Q5SS00 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zdbf2Q5SS00 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zdbf2Q5SS00 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zdbf2Q5SS00 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Zdbf2Q5SS00 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Zdbf2Q5SS00 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Zdbf2Q5SS00 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Zdbf2Q5SS00 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Zdbf2Q5SS00 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Zdbf2Q5SS00 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zdbf2Q5SS00 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zdbf2Q5SS00 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zdbf2Q5SS00 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zdbf2Q5SS00 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zdbf2Q5SS00 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Zdbf2Q5SS00 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zdbf2Q5SS00 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zdbf2Q5SS00 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zdbf2Q5SS00 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zdbf2Q5SS00 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zdbf2Q5SS00 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zdbf2Q5SS00 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zdbf2Q5SS00 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Zdbf2Q5SS00 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zdbf2Q5SS00 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zdbf2Q5SS00 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zdbf2Q5SS00 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zdbf2Q5SS00 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zdbf2Q5SS00 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zdbf2Q5SS00 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Zdbf2Q5SS00 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zdbf2Q5SS00 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Zdbf2Q5SS00 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Zdbf2Q5SS00 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Zdbf2Q5SS00 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zdbf2Q5SS00 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Zdbf2Q5SS00 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zdbf2Q5SS00 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zdbf2Q5SS00 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Zdbf2Q5SS00 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Zdbf2Q5SS00 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Zdbf2Q5SS00 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Zdbf2Q5SS00 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Zdbf2Q5SS00 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Zdbf2Q5SS00 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zdbf2Q5SS00 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Zdbf2Q5SS00 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
Zdbf2Q5SS00 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zdbf2Q5SS00 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zdbf2Q5SS00 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zdbf2Q5SS00 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zdbf2Q5SS00 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zdbf2Q5SS00 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zdbf2Q5SS00 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zdbf2Q5SS00 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zdbf2Q5SS00 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Zdbf2Q5SS00 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zdbf2Q5SS00 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zdbf2Q5SS00 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zdbf2Q5SS00 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zdbf2Q5SS00 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zdbf2Q5SS00 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Zdbf2Q5SS00 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Zdbf2Q5SS00 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zdbf2Q5SS00 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Zdbf2Q5SS00 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zdbf2Q5SS00 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zdbf2Q5SS00 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zdbf2Q5SS00 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zdbf2Q5SS00 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zdbf2Q5SS00 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zdbf2Q5SS00 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zdbf2Q5SS00 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zdbf2Q5SS00 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zdbf2Q5SS00 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zdbf2Q5SS00 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zdbf2Q5SS00 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zdbf2Q5SS00 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zdbf2Q5SS00 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zdbf2Q5SS00 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Zdbf2Q5SS00 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Zdbf2Q5SS00 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Zdbf2Q5SS00 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Zdbf2Q5SS00 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Zdbf2Q5SS00 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Zdbf2Q5SS00 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zdbf2Q5SS00 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Zdbf2Q5SS00 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Zdbf2Q5SS00 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zdbf2Q5SS00 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zdbf2Q5SS00 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zdbf2Q5SS00 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zdbf2Q5SS00 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Zdbf2Q5SS00 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zdbf2Q5SS00 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zdbf2Q5SS00 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms