Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc85aQ5SP85 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc85aQ5SP85 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc85aQ5SP85 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc85aQ5SP85 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc85aQ5SP85 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc85aQ5SP85 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc85aQ5SP85 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc85aQ5SP85 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc85aQ5SP85 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc85aQ5SP85 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc85aQ5SP85 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc85aQ5SP85 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc85aQ5SP85 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc85aQ5SP85 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc85aQ5SP85 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc85aQ5SP85 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc85aQ5SP85 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc85aQ5SP85 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc85aQ5SP85 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc85aQ5SP85 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc85aQ5SP85 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc85aQ5SP85 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc85aQ5SP85 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc85aQ5SP85 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc85aQ5SP85 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc85aQ5SP85 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc85aQ5SP85 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc85aQ5SP85 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc85aQ5SP85 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc85aQ5SP85 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc85aQ5SP85 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc85aQ5SP85 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc85aQ5SP85 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc85aQ5SP85 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc85aQ5SP85 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc85aQ5SP85 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc85aQ5SP85 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc85aQ5SP85 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc85aQ5SP85 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc85aQ5SP85 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc85aQ5SP85 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc85aQ5SP85 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc85aQ5SP85 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc85aQ5SP85 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc85aQ5SP85 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc85aQ5SP85 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc85aQ5SP85 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc85aQ5SP85 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc85aQ5SP85 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc85aQ5SP85 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc85aQ5SP85 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc85aQ5SP85 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc85aQ5SP85 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc85aQ5SP85 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc85aQ5SP85 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc85aQ5SP85 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc85aQ5SP85 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc85aQ5SP85 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc85aQ5SP85 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc85aQ5SP85 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc85aQ5SP85 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc85aQ5SP85 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc85aQ5SP85 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc85aQ5SP85 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc85aQ5SP85 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc85aQ5SP85 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc85aQ5SP85 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc85aQ5SP85 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc85aQ5SP85 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc85aQ5SP85 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc85aQ5SP85 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc85aQ5SP85 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc85aQ5SP85 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc85aQ5SP85 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc85aQ5SP85 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc85aQ5SP85 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc85aQ5SP85 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc85aQ5SP85 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc85aQ5SP85 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc85aQ5SP85 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc85aQ5SP85 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc85aQ5SP85 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc85aQ5SP85 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc85aQ5SP85 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc85aQ5SP85 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc85aQ5SP85 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc85aQ5SP85 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc85aQ5SP85 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc85aQ5SP85 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc85aQ5SP85 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc85aQ5SP85 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc85aQ5SP85 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc85aQ5SP85 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc85aQ5SP85 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc85aQ5SP85 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc85aQ5SP85 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc85aQ5SP85 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms