Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PkdccQ5RJI4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PkdccQ5RJI4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PkdccQ5RJI4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PkdccQ5RJI4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PkdccQ5RJI4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PkdccQ5RJI4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PkdccQ5RJI4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PkdccQ5RJI4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PkdccQ5RJI4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PkdccQ5RJI4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PkdccQ5RJI4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PkdccQ5RJI4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PkdccQ5RJI4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PkdccQ5RJI4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PkdccQ5RJI4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PkdccQ5RJI4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PkdccQ5RJI4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PkdccQ5RJI4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PkdccQ5RJI4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PkdccQ5RJI4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PkdccQ5RJI4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PkdccQ5RJI4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PkdccQ5RJI4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PkdccQ5RJI4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PkdccQ5RJI4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PkdccQ5RJI4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PkdccQ5RJI4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PkdccQ5RJI4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PkdccQ5RJI4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PkdccQ5RJI4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PkdccQ5RJI4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PkdccQ5RJI4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PkdccQ5RJI4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PkdccQ5RJI4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PkdccQ5RJI4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PkdccQ5RJI4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PkdccQ5RJI4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PkdccQ5RJI4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PkdccQ5RJI4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PkdccQ5RJI4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PkdccQ5RJI4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PkdccQ5RJI4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PkdccQ5RJI4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PkdccQ5RJI4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PkdccQ5RJI4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PkdccQ5RJI4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PkdccQ5RJI4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PkdccQ5RJI4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PkdccQ5RJI4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PkdccQ5RJI4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PkdccQ5RJI4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PkdccQ5RJI4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PkdccQ5RJI4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PkdccQ5RJI4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PkdccQ5RJI4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PkdccQ5RJI4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PkdccQ5RJI4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PkdccQ5RJI4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PkdccQ5RJI4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PkdccQ5RJI4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PkdccQ5RJI4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PkdccQ5RJI4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PkdccQ5RJI4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PkdccQ5RJI4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PkdccQ5RJI4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PkdccQ5RJI4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PkdccQ5RJI4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PkdccQ5RJI4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PkdccQ5RJI4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PkdccQ5RJI4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PkdccQ5RJI4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PkdccQ5RJI4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PkdccQ5RJI4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PkdccQ5RJI4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PkdccQ5RJI4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PkdccQ5RJI4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PkdccQ5RJI4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PkdccQ5RJI4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PkdccQ5RJI4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PkdccQ5RJI4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PkdccQ5RJI4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PkdccQ5RJI4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PkdccQ5RJI4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PkdccQ5RJI4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PkdccQ5RJI4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PkdccQ5RJI4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PkdccQ5RJI4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PkdccQ5RJI4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PkdccQ5RJI4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PkdccQ5RJI4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PkdccQ5RJI4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PkdccQ5RJI4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PkdccQ5RJI4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PkdccQ5RJI4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PkdccQ5RJI4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PkdccQ5RJI4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PkdccQ5RJI4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PkdccQ5RJI4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PkdccQ5RJI4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms