Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sfmbt2Q5DTW2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sfmbt2Q5DTW2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sfmbt2Q5DTW2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sfmbt2Q5DTW2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sfmbt2Q5DTW2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sfmbt2Q5DTW2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sfmbt2Q5DTW2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sfmbt2Q5DTW2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sfmbt2Q5DTW2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sfmbt2Q5DTW2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sfmbt2Q5DTW2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sfmbt2Q5DTW2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sfmbt2Q5DTW2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sfmbt2Q5DTW2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sfmbt2Q5DTW2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sfmbt2Q5DTW2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sfmbt2Q5DTW2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sfmbt2Q5DTW2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sfmbt2Q5DTW2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sfmbt2Q5DTW2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sfmbt2Q5DTW2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sfmbt2Q5DTW2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sfmbt2Q5DTW2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sfmbt2Q5DTW2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sfmbt2Q5DTW2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sfmbt2Q5DTW2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sfmbt2Q5DTW2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sfmbt2Q5DTW2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sfmbt2Q5DTW2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sfmbt2Q5DTW2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sfmbt2Q5DTW2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sfmbt2Q5DTW2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sfmbt2Q5DTW2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sfmbt2Q5DTW2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sfmbt2Q5DTW2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sfmbt2Q5DTW2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sfmbt2Q5DTW2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sfmbt2Q5DTW2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sfmbt2Q5DTW2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sfmbt2Q5DTW2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sfmbt2Q5DTW2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sfmbt2Q5DTW2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sfmbt2Q5DTW2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sfmbt2Q5DTW2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sfmbt2Q5DTW2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sfmbt2Q5DTW2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sfmbt2Q5DTW2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sfmbt2Q5DTW2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sfmbt2Q5DTW2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sfmbt2Q5DTW2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sfmbt2Q5DTW2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sfmbt2Q5DTW2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sfmbt2Q5DTW2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sfmbt2Q5DTW2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sfmbt2Q5DTW2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sfmbt2Q5DTW2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sfmbt2Q5DTW2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sfmbt2Q5DTW2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sfmbt2Q5DTW2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sfmbt2Q5DTW2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sfmbt2Q5DTW2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sfmbt2Q5DTW2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sfmbt2Q5DTW2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sfmbt2Q5DTW2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sfmbt2Q5DTW2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sfmbt2Q5DTW2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sfmbt2Q5DTW2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sfmbt2Q5DTW2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sfmbt2Q5DTW2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sfmbt2Q5DTW2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sfmbt2Q5DTW2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sfmbt2Q5DTW2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sfmbt2Q5DTW2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sfmbt2Q5DTW2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sfmbt2Q5DTW2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sfmbt2Q5DTW2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sfmbt2Q5DTW2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sfmbt2Q5DTW2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sfmbt2Q5DTW2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sfmbt2Q5DTW2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sfmbt2Q5DTW2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sfmbt2Q5DTW2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sfmbt2Q5DTW2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sfmbt2Q5DTW2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sfmbt2Q5DTW2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sfmbt2Q5DTW2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sfmbt2Q5DTW2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sfmbt2Q5DTW2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sfmbt2Q5DTW2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sfmbt2Q5DTW2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sfmbt2Q5DTW2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sfmbt2Q5DTW2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sfmbt2Q5DTW2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sfmbt2Q5DTW2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sfmbt2Q5DTW2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sfmbt2Q5DTW2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms