Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spsb3Q571F5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spsb3Q571F5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spsb3Q571F5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spsb3Q571F5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spsb3Q571F5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spsb3Q571F5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spsb3Q571F5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spsb3Q571F5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spsb3Q571F5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spsb3Q571F5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spsb3Q571F5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spsb3Q571F5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spsb3Q571F5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spsb3Q571F5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spsb3Q571F5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spsb3Q571F5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spsb3Q571F5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Spsb3Q571F5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spsb3Q571F5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spsb3Q571F5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Spsb3Q571F5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spsb3Q571F5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spsb3Q571F5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Spsb3Q571F5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spsb3Q571F5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spsb3Q571F5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spsb3Q571F5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spsb3Q571F5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spsb3Q571F5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms