Protein–RNA interactions for Protein: Q56A07

Scn2b, Sodium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2bQ56A07 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn2bQ56A07 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn2bQ56A07 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn2bQ56A07 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn2bQ56A07 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn2bQ56A07 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn2bQ56A07 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn2bQ56A07 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn2bQ56A07 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn2bQ56A07 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn2bQ56A07 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn2bQ56A07 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn2bQ56A07 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn2bQ56A07 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn2bQ56A07 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn2bQ56A07 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn2bQ56A07 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn2bQ56A07 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn2bQ56A07 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn2bQ56A07 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scn2bQ56A07 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scn2bQ56A07 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scn2bQ56A07 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scn2bQ56A07 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scn2bQ56A07 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scn2bQ56A07 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scn2bQ56A07 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn2bQ56A07 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn2bQ56A07 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn2bQ56A07 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn2bQ56A07 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn2bQ56A07 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn2bQ56A07 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn2bQ56A07 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn2bQ56A07 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn2bQ56A07 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn2bQ56A07 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn2bQ56A07 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn2bQ56A07 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn2bQ56A07 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn2bQ56A07 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn2bQ56A07 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn2bQ56A07 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn2bQ56A07 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn2bQ56A07 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn2bQ56A07 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn2bQ56A07 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn2bQ56A07 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn2bQ56A07 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn2bQ56A07 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn2bQ56A07 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scn2bQ56A07 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scn2bQ56A07 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn2bQ56A07 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn2bQ56A07 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn2bQ56A07 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn2bQ56A07 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn2bQ56A07 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn2bQ56A07 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn2bQ56A07 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn2bQ56A07 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn2bQ56A07 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn2bQ56A07 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn2bQ56A07 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn2bQ56A07 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn2bQ56A07 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn2bQ56A07 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn2bQ56A07 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn2bQ56A07 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn2bQ56A07 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn2bQ56A07 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn2bQ56A07 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn2bQ56A07 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn2bQ56A07 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn2bQ56A07 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn2bQ56A07 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn2bQ56A07 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn2bQ56A07 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn2bQ56A07 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn2bQ56A07 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn2bQ56A07 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn2bQ56A07 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn2bQ56A07 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn2bQ56A07 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn2bQ56A07 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn2bQ56A07 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn2bQ56A07 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn2bQ56A07 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn2bQ56A07 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn2bQ56A07 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn2bQ56A07 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn2bQ56A07 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn2bQ56A07 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn2bQ56A07 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn2bQ56A07 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn2bQ56A07 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn2bQ56A07 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn2bQ56A07 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn2bQ56A07 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn2bQ56A07 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms