Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5935Q497S0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5935Q497S0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5935Q497S0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5935Q497S0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5935Q497S0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm5935Q497S0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm5935Q497S0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm5935Q497S0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm5935Q497S0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm5935Q497S0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm5935Q497S0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm5935Q497S0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm5935Q497S0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm5935Q497S0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm5935Q497S0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm5935Q497S0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm5935Q497S0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm5935Q497S0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm5935Q497S0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm5935Q497S0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm5935Q497S0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm5935Q497S0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm5935Q497S0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm5935Q497S0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm5935Q497S0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm5935Q497S0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm5935Q497S0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm5935Q497S0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm5935Q497S0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm5935Q497S0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm5935Q497S0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm5935Q497S0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm5935Q497S0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm5935Q497S0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm5935Q497S0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm5935Q497S0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm5935Q497S0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm5935Q497S0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm5935Q497S0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm5935Q497S0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm5935Q497S0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm5935Q497S0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm5935Q497S0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm5935Q497S0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm5935Q497S0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm5935Q497S0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm5935Q497S0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm5935Q497S0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm5935Q497S0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm5935Q497S0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm5935Q497S0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm5935Q497S0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm5935Q497S0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm5935Q497S0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm5935Q497S0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm5935Q497S0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm5935Q497S0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm5935Q497S0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm5935Q497S0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm5935Q497S0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm5935Q497S0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm5935Q497S0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm5935Q497S0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm5935Q497S0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm5935Q497S0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm5935Q497S0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm5935Q497S0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm5935Q497S0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm5935Q497S0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm5935Q497S0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm5935Q497S0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm5935Q497S0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm5935Q497S0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm5935Q497S0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm5935Q497S0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm5935Q497S0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm5935Q497S0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm5935Q497S0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm5935Q497S0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm5935Q497S0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm5935Q497S0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm5935Q497S0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm5935Q497S0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm5935Q497S0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm5935Q497S0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm5935Q497S0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm5935Q497S0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm5935Q497S0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm5935Q497S0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm5935Q497S0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm5935Q497S0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm5935Q497S0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm5935Q497S0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm5935Q497S0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm5935Q497S0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5935Q497S0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5935Q497S0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5935Q497S0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm5935Q497S0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms