Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0W9

4930432M17Rik, RIKEN cDNA 4930432M17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930432M17RikQ3V0W9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930432M17RikQ3V0W9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930432M17RikQ3V0W9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930432M17RikQ3V0W9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930432M17RikQ3V0W9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930432M17RikQ3V0W9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930432M17RikQ3V0W9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930432M17RikQ3V0W9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930432M17RikQ3V0W9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930432M17RikQ3V0W9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930432M17RikQ3V0W9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
4930432M17RikQ3V0W9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930432M17RikQ3V0W9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930432M17RikQ3V0W9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930432M17RikQ3V0W9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930432M17RikQ3V0W9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930432M17RikQ3V0W9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930432M17RikQ3V0W9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930432M17RikQ3V0W9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930432M17RikQ3V0W9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4930432M17RikQ3V0W9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4930432M17RikQ3V0W9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930432M17RikQ3V0W9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930432M17RikQ3V0W9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930432M17RikQ3V0W9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930432M17RikQ3V0W9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms