Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0B4

Cfap65, Cilia- and flagella-associated protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 1,847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap65Q3V0B4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Cfap65Q3V0B4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cfap65Q3V0B4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cfap65Q3V0B4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
Cfap65Q3V0B4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
Cfap65Q3V0B4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cfap65Q3V0B4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cfap65Q3V0B4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cfap65Q3V0B4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cfap65Q3V0B4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Cfap65Q3V0B4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cfap65Q3V0B4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Cfap65Q3V0B4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cfap65Q3V0B4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cfap65Q3V0B4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cfap65Q3V0B4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cfap65Q3V0B4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cfap65Q3V0B4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cfap65Q3V0B4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cfap65Q3V0B4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cfap65Q3V0B4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cfap65Q3V0B4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cfap65Q3V0B4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cfap65Q3V0B4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Cfap65Q3V0B4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cfap65Q3V0B4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cfap65Q3V0B4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cfap65Q3V0B4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cfap65Q3V0B4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cfap65Q3V0B4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cfap65Q3V0B4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cfap65Q3V0B4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cfap65Q3V0B4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cfap65Q3V0B4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cfap65Q3V0B4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Cfap65Q3V0B4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cfap65Q3V0B4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cfap65Q3V0B4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cfap65Q3V0B4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Cfap65Q3V0B4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cfap65Q3V0B4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cfap65Q3V0B4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cfap65Q3V0B4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cfap65Q3V0B4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cfap65Q3V0B4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cfap65Q3V0B4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cfap65Q3V0B4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cfap65Q3V0B4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cfap65Q3V0B4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cfap65Q3V0B4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cfap65Q3V0B4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cfap65Q3V0B4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cfap65Q3V0B4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cfap65Q3V0B4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cfap65Q3V0B4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cfap65Q3V0B4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cfap65Q3V0B4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Cfap65Q3V0B4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cfap65Q3V0B4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cfap65Q3V0B4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cfap65Q3V0B4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cfap65Q3V0B4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cfap65Q3V0B4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cfap65Q3V0B4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Cfap65Q3V0B4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Cfap65Q3V0B4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cfap65Q3V0B4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Cfap65Q3V0B4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cfap65Q3V0B4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cfap65Q3V0B4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cfap65Q3V0B4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cfap65Q3V0B4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cfap65Q3V0B4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cfap65Q3V0B4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cfap65Q3V0B4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cfap65Q3V0B4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cfap65Q3V0B4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cfap65Q3V0B4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Cfap65Q3V0B4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cfap65Q3V0B4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Cfap65Q3V0B4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Cfap65Q3V0B4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cfap65Q3V0B4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cfap65Q3V0B4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cfap65Q3V0B4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cfap65Q3V0B4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cfap65Q3V0B4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cfap65Q3V0B4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cfap65Q3V0B4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cfap65Q3V0B4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cfap65Q3V0B4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cfap65Q3V0B4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Cfap65Q3V0B4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Cfap65Q3V0B4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Cfap65Q3V0B4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cfap65Q3V0B4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cfap65Q3V0B4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cfap65Q3V0B4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cfap65Q3V0B4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cfap65Q3V0B4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms