Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
4933416C03RikQ3V063 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
4933416C03RikQ3V063 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
4933416C03RikQ3V063 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
4933416C03RikQ3V063 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
4933416C03RikQ3V063 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
4933416C03RikQ3V063 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
4933416C03RikQ3V063 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
4933416C03RikQ3V063 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
4933416C03RikQ3V063 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
4933416C03RikQ3V063 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
4933416C03RikQ3V063 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
4933416C03RikQ3V063 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
4933416C03RikQ3V063 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
4933416C03RikQ3V063 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
4933416C03RikQ3V063 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
4933416C03RikQ3V063 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
4933416C03RikQ3V063 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
4933416C03RikQ3V063 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
4933416C03RikQ3V063 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
4933416C03RikQ3V063 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
4933416C03RikQ3V063 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
4933416C03RikQ3V063 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
4933416C03RikQ3V063 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
4933416C03RikQ3V063 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
4933416C03RikQ3V063 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
4933416C03RikQ3V063 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
4933416C03RikQ3V063 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
4933416C03RikQ3V063 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
4933416C03RikQ3V063 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
4933416C03RikQ3V063 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
4933416C03RikQ3V063 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
4933416C03RikQ3V063 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
4933416C03RikQ3V063 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
4933416C03RikQ3V063 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
4933416C03RikQ3V063 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
4933416C03RikQ3V063 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
4933416C03RikQ3V063 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
4933416C03RikQ3V063 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
4933416C03RikQ3V063 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
4933416C03RikQ3V063 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
4933416C03RikQ3V063 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
4933416C03RikQ3V063 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
4933416C03RikQ3V063 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
4933416C03RikQ3V063 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
4933416C03RikQ3V063 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
4933416C03RikQ3V063 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
4933416C03RikQ3V063 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
4933416C03RikQ3V063 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
4933416C03RikQ3V063 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
4933416C03RikQ3V063 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
4933416C03RikQ3V063 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
4933416C03RikQ3V063 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
4933416C03RikQ3V063 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
4933416C03RikQ3V063 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
4933416C03RikQ3V063 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
4933416C03RikQ3V063 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
4933416C03RikQ3V063 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
4933416C03RikQ3V063 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
4933416C03RikQ3V063 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
4933416C03RikQ3V063 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
4933416C03RikQ3V063 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
4933416C03RikQ3V063 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
4933416C03RikQ3V063 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
4933416C03RikQ3V063 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
4933416C03RikQ3V063 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
4933416C03RikQ3V063 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
4933416C03RikQ3V063 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
4933416C03RikQ3V063 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
4933416C03RikQ3V063 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
4933416C03RikQ3V063 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
4933416C03RikQ3V063 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
4933416C03RikQ3V063 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
4933416C03RikQ3V063 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
4933416C03RikQ3V063 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
4933416C03RikQ3V063 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
4933416C03RikQ3V063 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
4933416C03RikQ3V063 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
4933416C03RikQ3V063 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
4933416C03RikQ3V063 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
4933416C03RikQ3V063 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
4933416C03RikQ3V063 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
4933416C03RikQ3V063 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
4933416C03RikQ3V063 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
4933416C03RikQ3V063 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
4933416C03RikQ3V063 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
4933416C03RikQ3V063 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
4933416C03RikQ3V063 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
4933416C03RikQ3V063 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
4933416C03RikQ3V063 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
4933416C03RikQ3V063 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
4933416C03RikQ3V063 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
4933416C03RikQ3V063 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
4933416C03RikQ3V063 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
4933416C03RikQ3V063 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
4933416C03RikQ3V063 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
4933416C03RikQ3V063 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
4933416C03RikQ3V063 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
4933416C03RikQ3V063 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
4933416C03RikQ3V063 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms