Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZV7

UPF0577 protein KIAA1324-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UZV7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UZV7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UZV7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UZV7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UZV7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UZV7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UZV7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UZV7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UZV7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UZV7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UZV7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UZV7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3UZV7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3UZV7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3UZV7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3UZV7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3UZV7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3UZV7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3UZV7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3UZV7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3UZV7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3UZV7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3UZV7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3UZV7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3UZV7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3UZV7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UZV7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UZV7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UZV7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UZV7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3UZV7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3UZV7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3UZV7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3UZV7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3UZV7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3UZV7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3UZV7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3UZV7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3UZV7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3UZV7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3UZV7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3UZV7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3UZV7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q3UZV7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Q3UZV7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3UZV7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3UZV7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3UZV7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3UZV7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3UZV7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3UZV7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3UZV7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3UZV7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UZV7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UZV7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UZV7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UZV7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UZV7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UZV7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UZV7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UZV7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UZV7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UZV7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3UZV7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3UZV7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3UZV7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3UZV7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3UZV7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3UZV7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3UZV7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3UZV7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3UZV7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3UZV7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UZV7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UZV7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UZV7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UZV7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3UZV7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3UZV7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3UZV7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3UZV7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3UZV7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3UZV7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3UZV7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3UZV7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3UZV7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3UZV7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3UZV7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3UZV7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3UZV7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3UZV7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q3UZV7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q3UZV7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q3UZV7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q3UZV7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q3UZV7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q3UZV7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q3UZV7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q3UZV7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q3UZV7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms