Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnga4Q3UW12 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnga4Q3UW12 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnga4Q3UW12 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnga4Q3UW12 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnga4Q3UW12 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnga4Q3UW12 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnga4Q3UW12 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnga4Q3UW12 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnga4Q3UW12 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnga4Q3UW12 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnga4Q3UW12 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnga4Q3UW12 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnga4Q3UW12 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnga4Q3UW12 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnga4Q3UW12 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnga4Q3UW12 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnga4Q3UW12 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnga4Q3UW12 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnga4Q3UW12 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnga4Q3UW12 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnga4Q3UW12 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnga4Q3UW12 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnga4Q3UW12 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnga4Q3UW12 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnga4Q3UW12 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnga4Q3UW12 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnga4Q3UW12 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnga4Q3UW12 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnga4Q3UW12 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga4Q3UW12 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga4Q3UW12 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga4Q3UW12 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga4Q3UW12 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnga4Q3UW12 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnga4Q3UW12 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnga4Q3UW12 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnga4Q3UW12 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnga4Q3UW12 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnga4Q3UW12 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnga4Q3UW12 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnga4Q3UW12 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnga4Q3UW12 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnga4Q3UW12 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnga4Q3UW12 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnga4Q3UW12 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnga4Q3UW12 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnga4Q3UW12 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnga4Q3UW12 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnga4Q3UW12 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga4Q3UW12 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga4Q3UW12 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga4Q3UW12 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnga4Q3UW12 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnga4Q3UW12 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnga4Q3UW12 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnga4Q3UW12 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnga4Q3UW12 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnga4Q3UW12 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnga4Q3UW12 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnga4Q3UW12 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnga4Q3UW12 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnga4Q3UW12 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms