Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nr1d1Q3UV55 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nr1d1Q3UV55 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nr1d1Q3UV55 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nr1d1Q3UV55 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nr1d1Q3UV55 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nr1d1Q3UV55 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nr1d1Q3UV55 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr1d1Q3UV55 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr1d1Q3UV55 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr1d1Q3UV55 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr1d1Q3UV55 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nr1d1Q3UV55 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nr1d1Q3UV55 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nr1d1Q3UV55 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nr1d1Q3UV55 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nr1d1Q3UV55 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr1d1Q3UV55 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr1d1Q3UV55 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr1d1Q3UV55 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr1d1Q3UV55 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr1d1Q3UV55 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr1d1Q3UV55 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nr1d1Q3UV55 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nr1d1Q3UV55 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nr1d1Q3UV55 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nr1d1Q3UV55 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nr1d1Q3UV55 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nr1d1Q3UV55 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr1d1Q3UV55 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr1d1Q3UV55 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr1d1Q3UV55 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr1d1Q3UV55 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr1d1Q3UV55 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr1d1Q3UV55 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr1d1Q3UV55 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr1d1Q3UV55 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nr1d1Q3UV55 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nr1d1Q3UV55 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nr1d1Q3UV55 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nr1d1Q3UV55 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nr1d1Q3UV55 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nr1d1Q3UV55 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nr1d1Q3UV55 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms