Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
B230104I21RikQ3USW4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
B230104I21RikQ3USW4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
B230104I21RikQ3USW4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
B230104I21RikQ3USW4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
B230104I21RikQ3USW4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
B230104I21RikQ3USW4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
B230104I21RikQ3USW4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
B230104I21RikQ3USW4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
B230104I21RikQ3USW4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
B230104I21RikQ3USW4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
B230104I21RikQ3USW4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
B230104I21RikQ3USW4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
B230104I21RikQ3USW4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
B230104I21RikQ3USW4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
B230104I21RikQ3USW4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
B230104I21RikQ3USW4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
B230104I21RikQ3USW4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
B230104I21RikQ3USW4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
B230104I21RikQ3USW4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
B230104I21RikQ3USW4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
B230104I21RikQ3USW4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
B230104I21RikQ3USW4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
B230104I21RikQ3USW4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
B230104I21RikQ3USW4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
B230104I21RikQ3USW4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
B230104I21RikQ3USW4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
B230104I21RikQ3USW4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
B230104I21RikQ3USW4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
B230104I21RikQ3USW4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
B230104I21RikQ3USW4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
B230104I21RikQ3USW4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
B230104I21RikQ3USW4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
B230104I21RikQ3USW4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
B230104I21RikQ3USW4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
B230104I21RikQ3USW4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
B230104I21RikQ3USW4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
B230104I21RikQ3USW4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
B230104I21RikQ3USW4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
B230104I21RikQ3USW4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
B230104I21RikQ3USW4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
B230104I21RikQ3USW4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
B230104I21RikQ3USW4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
B230104I21RikQ3USW4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
B230104I21RikQ3USW4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
B230104I21RikQ3USW4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
B230104I21RikQ3USW4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
B230104I21RikQ3USW4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
B230104I21RikQ3USW4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
B230104I21RikQ3USW4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
B230104I21RikQ3USW4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
B230104I21RikQ3USW4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B230104I21RikQ3USW4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B230104I21RikQ3USW4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
B230104I21RikQ3USW4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
B230104I21RikQ3USW4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
B230104I21RikQ3USW4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B230104I21RikQ3USW4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B230104I21RikQ3USW4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
B230104I21RikQ3USW4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
B230104I21RikQ3USW4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
B230104I21RikQ3USW4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
B230104I21RikQ3USW4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
B230104I21RikQ3USW4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
B230104I21RikQ3USW4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
B230104I21RikQ3USW4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
B230104I21RikQ3USW4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B230104I21RikQ3USW4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
B230104I21RikQ3USW4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B230104I21RikQ3USW4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
B230104I21RikQ3USW4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
B230104I21RikQ3USW4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
B230104I21RikQ3USW4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
B230104I21RikQ3USW4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
B230104I21RikQ3USW4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
B230104I21RikQ3USW4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
B230104I21RikQ3USW4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
B230104I21RikQ3USW4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
B230104I21RikQ3USW4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
B230104I21RikQ3USW4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
B230104I21RikQ3USW4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
B230104I21RikQ3USW4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
B230104I21RikQ3USW4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B230104I21RikQ3USW4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
B230104I21RikQ3USW4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B230104I21RikQ3USW4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
B230104I21RikQ3USW4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
B230104I21RikQ3USW4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
B230104I21RikQ3USW4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B230104I21RikQ3USW4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B230104I21RikQ3USW4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
B230104I21RikQ3USW4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
B230104I21RikQ3USW4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
B230104I21RikQ3USW4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
B230104I21RikQ3USW4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
B230104I21RikQ3USW4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
B230104I21RikQ3USW4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
B230104I21RikQ3USW4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
B230104I21RikQ3USW4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
B230104I21RikQ3USW4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms