Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP38

Cracr2a, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2aQ3UP38 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cracr2aQ3UP38 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cracr2aQ3UP38 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cracr2aQ3UP38 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cracr2aQ3UP38 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cracr2aQ3UP38 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cracr2aQ3UP38 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cracr2aQ3UP38 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cracr2aQ3UP38 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cracr2aQ3UP38 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cracr2aQ3UP38 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cracr2aQ3UP38 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cracr2aQ3UP38 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cracr2aQ3UP38 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cracr2aQ3UP38 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cracr2aQ3UP38 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cracr2aQ3UP38 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cracr2aQ3UP38 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cracr2aQ3UP38 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cracr2aQ3UP38 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cracr2aQ3UP38 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cracr2aQ3UP38 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cracr2aQ3UP38 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cracr2aQ3UP38 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cracr2aQ3UP38 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cracr2aQ3UP38 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cracr2aQ3UP38 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cracr2aQ3UP38 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cracr2aQ3UP38 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cracr2aQ3UP38 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cracr2aQ3UP38 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cracr2aQ3UP38 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cracr2aQ3UP38 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cracr2aQ3UP38 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cracr2aQ3UP38 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cracr2aQ3UP38 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cracr2aQ3UP38 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cracr2aQ3UP38 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cracr2aQ3UP38 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cracr2aQ3UP38 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cracr2aQ3UP38 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cracr2aQ3UP38 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cracr2aQ3UP38 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cracr2aQ3UP38 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cracr2aQ3UP38 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cracr2aQ3UP38 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cracr2aQ3UP38 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cracr2aQ3UP38 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cracr2aQ3UP38 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cracr2aQ3UP38 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cracr2aQ3UP38 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cracr2aQ3UP38 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cracr2aQ3UP38 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cracr2aQ3UP38 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cracr2aQ3UP38 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cracr2aQ3UP38 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cracr2aQ3UP38 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cracr2aQ3UP38 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cracr2aQ3UP38 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cracr2aQ3UP38 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cracr2aQ3UP38 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cracr2aQ3UP38 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cracr2aQ3UP38 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cracr2aQ3UP38 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cracr2aQ3UP38 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cracr2aQ3UP38 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cracr2aQ3UP38 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cracr2aQ3UP38 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cracr2aQ3UP38 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cracr2aQ3UP38 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cracr2aQ3UP38 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cracr2aQ3UP38 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cracr2aQ3UP38 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cracr2aQ3UP38 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cracr2aQ3UP38 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cracr2aQ3UP38 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cracr2aQ3UP38 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cracr2aQ3UP38 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cracr2aQ3UP38 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cracr2aQ3UP38 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cracr2aQ3UP38 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cracr2aQ3UP38 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cracr2aQ3UP38 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cracr2aQ3UP38 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cracr2aQ3UP38 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cracr2aQ3UP38 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cracr2aQ3UP38 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cracr2aQ3UP38 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cracr2aQ3UP38 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cracr2aQ3UP38 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cracr2aQ3UP38 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cracr2aQ3UP38 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cracr2aQ3UP38 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cracr2aQ3UP38 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cracr2aQ3UP38 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cracr2aQ3UP38 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cracr2aQ3UP38 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cracr2aQ3UP38 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cracr2aQ3UP38 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cracr2aQ3UP38 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms