Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP23

Tmem26, Transmembrane protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem26Q3UP23 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem26Q3UP23 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem26Q3UP23 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmem26Q3UP23 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmem26Q3UP23 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmem26Q3UP23 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmem26Q3UP23 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmem26Q3UP23 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem26Q3UP23 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem26Q3UP23 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem26Q3UP23 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem26Q3UP23 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem26Q3UP23 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem26Q3UP23 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem26Q3UP23 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem26Q3UP23 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem26Q3UP23 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem26Q3UP23 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem26Q3UP23 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem26Q3UP23 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem26Q3UP23 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem26Q3UP23 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem26Q3UP23 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem26Q3UP23 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem26Q3UP23 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem26Q3UP23 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem26Q3UP23 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem26Q3UP23 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem26Q3UP23 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem26Q3UP23 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem26Q3UP23 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmem26Q3UP23 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmem26Q3UP23 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem26Q3UP23 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem26Q3UP23 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem26Q3UP23 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem26Q3UP23 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem26Q3UP23 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem26Q3UP23 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem26Q3UP23 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem26Q3UP23 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem26Q3UP23 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem26Q3UP23 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem26Q3UP23 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem26Q3UP23 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem26Q3UP23 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem26Q3UP23 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem26Q3UP23 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem26Q3UP23 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem26Q3UP23 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem26Q3UP23 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem26Q3UP23 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem26Q3UP23 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem26Q3UP23 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmem26Q3UP23 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmem26Q3UP23 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmem26Q3UP23 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmem26Q3UP23 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmem26Q3UP23 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmem26Q3UP23 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem26Q3UP23 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem26Q3UP23 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem26Q3UP23 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem26Q3UP23 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem26Q3UP23 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem26Q3UP23 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem26Q3UP23 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem26Q3UP23 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem26Q3UP23 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem26Q3UP23 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem26Q3UP23 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem26Q3UP23 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem26Q3UP23 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem26Q3UP23 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem26Q3UP23 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem26Q3UP23 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem26Q3UP23 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem26Q3UP23 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem26Q3UP23 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem26Q3UP23 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem26Q3UP23 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem26Q3UP23 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem26Q3UP23 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem26Q3UP23 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem26Q3UP23 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem26Q3UP23 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem26Q3UP23 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem26Q3UP23 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem26Q3UP23 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem26Q3UP23 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem26Q3UP23 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem26Q3UP23 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem26Q3UP23 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem26Q3UP23 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmem26Q3UP23 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmem26Q3UP23 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmem26Q3UP23 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmem26Q3UP23 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmem26Q3UP23 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmem26Q3UP23 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms