Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Tmem253Q3UNB8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Tmem253Q3UNB8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,78■□□□□ 0,92
Tmem253Q3UNB8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Tmem253Q3UNB8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Tmem253Q3UNB8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Tmem253Q3UNB8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Tmem253Q3UNB8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20,78■□□□□ 0,92
Tmem253Q3UNB8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Tmem253Q3UNB8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Tmem253Q3UNB8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,76■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,76■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20,76■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,75■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20,75■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,74■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20,73■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20,73■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20,73■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20,73■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20,73■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,72■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20,71■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Tmem253Q3UNB8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Tmem253Q3UNB8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20,7■□□□□ 0,9
Tmem253Q3UNB8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Tmem253Q3UNB8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Tmem253Q3UNB8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,69■□□□□ 0,9
Tmem253Q3UNB8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Tmem253Q3UNB8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20,68■□□□□ 0,9
Tmem253Q3UNB8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20,68■□□□□ 0,9
Tmem253Q3UNB8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Tmem253Q3UNB8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20,68■□□□□ 0,9
Tmem253Q3UNB8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Tmem253Q3UNB8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Tmem253Q3UNB8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Tmem253Q3UNB8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Tmem253Q3UNB8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20,67■□□□□ 0,9
Tmem253Q3UNB8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Tmem253Q3UNB8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Tmem253Q3UNB8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Tmem253Q3UNB8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,66■□□□□ 0,9
Tmem253Q3UNB8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Tmem253Q3UNB8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Tmem253Q3UNB8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Tmem253Q3UNB8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Tmem253Q3UNB8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Tmem253Q3UNB8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Tmem253Q3UNB8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,65■□□□□ 0,9
Tmem253Q3UNB8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Tmem253Q3UNB8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Tmem253Q3UNB8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Tmem253Q3UNB8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,9
Tmem253Q3UNB8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20,64■□□□□ 0,89
Tmem253Q3UNB8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20,64■□□□□ 0,89
Tmem253Q3UNB8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Tmem253Q3UNB8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Tmem253Q3UNB8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Tmem253Q3UNB8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20,64■□□□□ 0,89
Tmem253Q3UNB8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,63■□□□□ 0,89
Tmem253Q3UNB8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Tmem253Q3UNB8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20,63■□□□□ 0,89
Tmem253Q3UNB8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Tmem253Q3UNB8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Tmem253Q3UNB8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,62■□□□□ 0,89
Tmem253Q3UNB8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Tmem253Q3UNB8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Tmem253Q3UNB8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20,61■□□□□ 0,89
Tmem253Q3UNB8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Tmem253Q3UNB8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Tmem253Q3UNB8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Tmem253Q3UNB8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20,59■□□□□ 0,89
Tmem253Q3UNB8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20,59■□□□□ 0,89
Tmem253Q3UNB8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,59■□□□□ 0,89
Tmem253Q3UNB8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Tmem253Q3UNB8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
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