Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Parp3Q3ULW8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Parp3Q3ULW8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Parp3Q3ULW8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Parp3Q3ULW8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Parp3Q3ULW8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Parp3Q3ULW8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Parp3Q3ULW8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Parp3Q3ULW8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Parp3Q3ULW8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Parp3Q3ULW8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Parp3Q3ULW8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Parp3Q3ULW8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Parp3Q3ULW8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Parp3Q3ULW8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Parp3Q3ULW8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Parp3Q3ULW8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Parp3Q3ULW8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Parp3Q3ULW8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Parp3Q3ULW8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Parp3Q3ULW8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Parp3Q3ULW8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Parp3Q3ULW8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Parp3Q3ULW8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Parp3Q3ULW8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Parp3Q3ULW8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Parp3Q3ULW8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Parp3Q3ULW8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Parp3Q3ULW8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Parp3Q3ULW8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Parp3Q3ULW8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Parp3Q3ULW8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Parp3Q3ULW8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Parp3Q3ULW8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Parp3Q3ULW8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Parp3Q3ULW8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Parp3Q3ULW8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Parp3Q3ULW8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Parp3Q3ULW8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Parp3Q3ULW8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Parp3Q3ULW8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Parp3Q3ULW8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Parp3Q3ULW8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Parp3Q3ULW8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Parp3Q3ULW8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Parp3Q3ULW8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Parp3Q3ULW8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Parp3Q3ULW8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Parp3Q3ULW8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Parp3Q3ULW8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Parp3Q3ULW8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Parp3Q3ULW8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Parp3Q3ULW8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Parp3Q3ULW8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Parp3Q3ULW8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Parp3Q3ULW8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Parp3Q3ULW8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Parp3Q3ULW8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Parp3Q3ULW8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Parp3Q3ULW8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Parp3Q3ULW8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Parp3Q3ULW8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Parp3Q3ULW8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Parp3Q3ULW8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Parp3Q3ULW8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Parp3Q3ULW8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Parp3Q3ULW8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Parp3Q3ULW8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Parp3Q3ULW8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Parp3Q3ULW8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Parp3Q3ULW8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Parp3Q3ULW8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Parp3Q3ULW8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Parp3Q3ULW8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Parp3Q3ULW8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Parp3Q3ULW8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Parp3Q3ULW8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Parp3Q3ULW8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Parp3Q3ULW8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Parp3Q3ULW8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Parp3Q3ULW8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Parp3Q3ULW8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Parp3Q3ULW8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Parp3Q3ULW8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Parp3Q3ULW8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Parp3Q3ULW8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Parp3Q3ULW8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Parp3Q3ULW8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Parp3Q3ULW8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Parp3Q3ULW8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Parp3Q3ULW8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Parp3Q3ULW8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Parp3Q3ULW8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Parp3Q3ULW8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Parp3Q3ULW8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Parp3Q3ULW8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Parp3Q3ULW8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Parp3Q3ULW8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Parp3Q3ULW8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Parp3Q3ULW8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms