Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULJ3

Upf3a, MCG3697, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf3aQ3ULJ3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Upf3aQ3ULJ3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Upf3aQ3ULJ3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Upf3aQ3ULJ3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Upf3aQ3ULJ3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Upf3aQ3ULJ3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Upf3aQ3ULJ3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Upf3aQ3ULJ3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Upf3aQ3ULJ3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Upf3aQ3ULJ3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Upf3aQ3ULJ3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Upf3aQ3ULJ3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Upf3aQ3ULJ3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Upf3aQ3ULJ3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Upf3aQ3ULJ3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Upf3aQ3ULJ3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Upf3aQ3ULJ3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Upf3aQ3ULJ3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Upf3aQ3ULJ3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Upf3aQ3ULJ3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Upf3aQ3ULJ3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Upf3aQ3ULJ3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Upf3aQ3ULJ3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Upf3aQ3ULJ3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Upf3aQ3ULJ3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Upf3aQ3ULJ3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Upf3aQ3ULJ3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Upf3aQ3ULJ3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Upf3aQ3ULJ3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Upf3aQ3ULJ3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Upf3aQ3ULJ3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Upf3aQ3ULJ3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Upf3aQ3ULJ3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Upf3aQ3ULJ3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Upf3aQ3ULJ3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Upf3aQ3ULJ3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Upf3aQ3ULJ3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Upf3aQ3ULJ3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Upf3aQ3ULJ3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Upf3aQ3ULJ3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Upf3aQ3ULJ3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Upf3aQ3ULJ3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Upf3aQ3ULJ3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Upf3aQ3ULJ3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Upf3aQ3ULJ3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Upf3aQ3ULJ3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Upf3aQ3ULJ3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Upf3aQ3ULJ3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Upf3aQ3ULJ3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Upf3aQ3ULJ3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Upf3aQ3ULJ3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Upf3aQ3ULJ3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Upf3aQ3ULJ3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Upf3aQ3ULJ3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Upf3aQ3ULJ3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Upf3aQ3ULJ3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Upf3aQ3ULJ3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Upf3aQ3ULJ3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Upf3aQ3ULJ3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Upf3aQ3ULJ3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Upf3aQ3ULJ3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Upf3aQ3ULJ3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Upf3aQ3ULJ3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Upf3aQ3ULJ3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Upf3aQ3ULJ3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Upf3aQ3ULJ3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Upf3aQ3ULJ3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Upf3aQ3ULJ3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Upf3aQ3ULJ3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Upf3aQ3ULJ3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Upf3aQ3ULJ3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Upf3aQ3ULJ3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Upf3aQ3ULJ3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Upf3aQ3ULJ3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Upf3aQ3ULJ3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Upf3aQ3ULJ3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Upf3aQ3ULJ3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Upf3aQ3ULJ3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Upf3aQ3ULJ3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Upf3aQ3ULJ3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Upf3aQ3ULJ3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Upf3aQ3ULJ3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Upf3aQ3ULJ3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Upf3aQ3ULJ3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Upf3aQ3ULJ3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Upf3aQ3ULJ3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Upf3aQ3ULJ3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Upf3aQ3ULJ3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Upf3aQ3ULJ3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Upf3aQ3ULJ3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Upf3aQ3ULJ3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Upf3aQ3ULJ3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Upf3aQ3ULJ3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Upf3aQ3ULJ3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Upf3aQ3ULJ3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Upf3aQ3ULJ3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Upf3aQ3ULJ3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Upf3aQ3ULJ3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Upf3aQ3ULJ3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Upf3aQ3ULJ3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms