Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU4

Fam83f, Protein FAM83F, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83fQ3UKU4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam83fQ3UKU4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam83fQ3UKU4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam83fQ3UKU4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam83fQ3UKU4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam83fQ3UKU4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam83fQ3UKU4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam83fQ3UKU4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam83fQ3UKU4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam83fQ3UKU4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam83fQ3UKU4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam83fQ3UKU4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam83fQ3UKU4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam83fQ3UKU4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam83fQ3UKU4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam83fQ3UKU4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam83fQ3UKU4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam83fQ3UKU4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam83fQ3UKU4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam83fQ3UKU4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam83fQ3UKU4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam83fQ3UKU4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam83fQ3UKU4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam83fQ3UKU4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam83fQ3UKU4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam83fQ3UKU4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam83fQ3UKU4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam83fQ3UKU4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam83fQ3UKU4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam83fQ3UKU4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam83fQ3UKU4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam83fQ3UKU4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam83fQ3UKU4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam83fQ3UKU4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam83fQ3UKU4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam83fQ3UKU4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam83fQ3UKU4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam83fQ3UKU4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam83fQ3UKU4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam83fQ3UKU4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam83fQ3UKU4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam83fQ3UKU4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam83fQ3UKU4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam83fQ3UKU4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam83fQ3UKU4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam83fQ3UKU4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam83fQ3UKU4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam83fQ3UKU4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam83fQ3UKU4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam83fQ3UKU4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam83fQ3UKU4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam83fQ3UKU4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam83fQ3UKU4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam83fQ3UKU4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam83fQ3UKU4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam83fQ3UKU4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam83fQ3UKU4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam83fQ3UKU4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam83fQ3UKU4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam83fQ3UKU4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam83fQ3UKU4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam83fQ3UKU4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam83fQ3UKU4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam83fQ3UKU4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam83fQ3UKU4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam83fQ3UKU4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam83fQ3UKU4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam83fQ3UKU4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam83fQ3UKU4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam83fQ3UKU4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam83fQ3UKU4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam83fQ3UKU4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam83fQ3UKU4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam83fQ3UKU4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam83fQ3UKU4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam83fQ3UKU4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam83fQ3UKU4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam83fQ3UKU4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam83fQ3UKU4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam83fQ3UKU4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam83fQ3UKU4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam83fQ3UKU4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam83fQ3UKU4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam83fQ3UKU4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam83fQ3UKU4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam83fQ3UKU4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam83fQ3UKU4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam83fQ3UKU4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam83fQ3UKU4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam83fQ3UKU4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam83fQ3UKU4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam83fQ3UKU4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam83fQ3UKU4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam83fQ3UKU4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam83fQ3UKU4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam83fQ3UKU4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam83fQ3UKU4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam83fQ3UKU4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam83fQ3UKU4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam83fQ3UKU4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms