Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Usp19Q3UJD6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Usp19Q3UJD6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Usp19Q3UJD6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
Usp19Q3UJD6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Usp19Q3UJD6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Usp19Q3UJD6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Usp19Q3UJD6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Usp19Q3UJD6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Usp19Q3UJD6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Usp19Q3UJD6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Usp19Q3UJD6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Usp19Q3UJD6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Usp19Q3UJD6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Usp19Q3UJD6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Usp19Q3UJD6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Usp19Q3UJD6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Usp19Q3UJD6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Usp19Q3UJD6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Usp19Q3UJD6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Usp19Q3UJD6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Usp19Q3UJD6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Usp19Q3UJD6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Usp19Q3UJD6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Usp19Q3UJD6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Usp19Q3UJD6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Usp19Q3UJD6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Usp19Q3UJD6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Usp19Q3UJD6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Usp19Q3UJD6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Usp19Q3UJD6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Usp19Q3UJD6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Usp19Q3UJD6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Usp19Q3UJD6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Usp19Q3UJD6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Usp19Q3UJD6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Usp19Q3UJD6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Usp19Q3UJD6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Usp19Q3UJD6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Usp19Q3UJD6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Usp19Q3UJD6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Usp19Q3UJD6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Usp19Q3UJD6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Usp19Q3UJD6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Usp19Q3UJD6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Usp19Q3UJD6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Usp19Q3UJD6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Usp19Q3UJD6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Usp19Q3UJD6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Usp19Q3UJD6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Usp19Q3UJD6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Usp19Q3UJD6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Usp19Q3UJD6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Usp19Q3UJD6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Usp19Q3UJD6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Usp19Q3UJD6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Usp19Q3UJD6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Usp19Q3UJD6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Usp19Q3UJD6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Usp19Q3UJD6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Usp19Q3UJD6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Usp19Q3UJD6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Usp19Q3UJD6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Usp19Q3UJD6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Usp19Q3UJD6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Usp19Q3UJD6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Usp19Q3UJD6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Usp19Q3UJD6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Usp19Q3UJD6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Usp19Q3UJD6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Usp19Q3UJD6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Usp19Q3UJD6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Usp19Q3UJD6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Usp19Q3UJD6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Usp19Q3UJD6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Usp19Q3UJD6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Usp19Q3UJD6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Usp19Q3UJD6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Usp19Q3UJD6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Usp19Q3UJD6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Usp19Q3UJD6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Usp19Q3UJD6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Usp19Q3UJD6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Usp19Q3UJD6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Usp19Q3UJD6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Usp19Q3UJD6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Usp19Q3UJD6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Usp19Q3UJD6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Usp19Q3UJD6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Usp19Q3UJD6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Usp19Q3UJD6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Usp19Q3UJD6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Usp19Q3UJD6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Usp19Q3UJD6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Usp19Q3UJD6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Usp19Q3UJD6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Usp19Q3UJD6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Usp19Q3UJD6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Usp19Q3UJD6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Usp19Q3UJD6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms