Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dtx3lQ3UIR3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dtx3lQ3UIR3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dtx3lQ3UIR3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dtx3lQ3UIR3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dtx3lQ3UIR3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Dtx3lQ3UIR3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dtx3lQ3UIR3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dtx3lQ3UIR3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dtx3lQ3UIR3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dtx3lQ3UIR3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dtx3lQ3UIR3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dtx3lQ3UIR3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dtx3lQ3UIR3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dtx3lQ3UIR3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dtx3lQ3UIR3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dtx3lQ3UIR3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Dtx3lQ3UIR3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dtx3lQ3UIR3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dtx3lQ3UIR3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Dtx3lQ3UIR3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dtx3lQ3UIR3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dtx3lQ3UIR3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Dtx3lQ3UIR3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Dtx3lQ3UIR3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dtx3lQ3UIR3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dtx3lQ3UIR3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Dtx3lQ3UIR3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dtx3lQ3UIR3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dtx3lQ3UIR3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dtx3lQ3UIR3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dtx3lQ3UIR3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dtx3lQ3UIR3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dtx3lQ3UIR3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dtx3lQ3UIR3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dtx3lQ3UIR3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dtx3lQ3UIR3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dtx3lQ3UIR3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms