Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx27Q3UHD6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx27Q3UHD6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx27Q3UHD6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx27Q3UHD6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx27Q3UHD6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx27Q3UHD6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx27Q3UHD6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx27Q3UHD6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx27Q3UHD6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx27Q3UHD6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx27Q3UHD6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx27Q3UHD6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx27Q3UHD6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snx27Q3UHD6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snx27Q3UHD6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Snx27Q3UHD6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snx27Q3UHD6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snx27Q3UHD6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snx27Q3UHD6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx27Q3UHD6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx27Q3UHD6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx27Q3UHD6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx27Q3UHD6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx27Q3UHD6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx27Q3UHD6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx27Q3UHD6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx27Q3UHD6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx27Q3UHD6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx27Q3UHD6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx27Q3UHD6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx27Q3UHD6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx27Q3UHD6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx27Q3UHD6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx27Q3UHD6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx27Q3UHD6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Snx27Q3UHD6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Snx27Q3UHD6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx27Q3UHD6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx27Q3UHD6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx27Q3UHD6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx27Q3UHD6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx27Q3UHD6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx27Q3UHD6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx27Q3UHD6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx27Q3UHD6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx27Q3UHD6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx27Q3UHD6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx27Q3UHD6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.1 ms