Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGS4

Mcrip1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip1Q3UGS4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mcrip1Q3UGS4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mcrip1Q3UGS4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms