Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nom1Q3UFM5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nom1Q3UFM5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nom1Q3UFM5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nom1Q3UFM5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nom1Q3UFM5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nom1Q3UFM5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nom1Q3UFM5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nom1Q3UFM5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nom1Q3UFM5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nom1Q3UFM5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nom1Q3UFM5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nom1Q3UFM5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nom1Q3UFM5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nom1Q3UFM5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nom1Q3UFM5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nom1Q3UFM5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nom1Q3UFM5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nom1Q3UFM5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nom1Q3UFM5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nom1Q3UFM5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nom1Q3UFM5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nom1Q3UFM5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nom1Q3UFM5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nom1Q3UFM5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nom1Q3UFM5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nom1Q3UFM5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nom1Q3UFM5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nom1Q3UFM5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nom1Q3UFM5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nom1Q3UFM5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nom1Q3UFM5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nom1Q3UFM5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nom1Q3UFM5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nom1Q3UFM5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nom1Q3UFM5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nom1Q3UFM5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nom1Q3UFM5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nom1Q3UFM5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nom1Q3UFM5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nom1Q3UFM5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nom1Q3UFM5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nom1Q3UFM5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nom1Q3UFM5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nom1Q3UFM5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nom1Q3UFM5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nom1Q3UFM5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nom1Q3UFM5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nom1Q3UFM5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nom1Q3UFM5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nom1Q3UFM5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Nom1Q3UFM5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nom1Q3UFM5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nom1Q3UFM5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nom1Q3UFM5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nom1Q3UFM5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nom1Q3UFM5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nom1Q3UFM5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nom1Q3UFM5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nom1Q3UFM5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nom1Q3UFM5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nom1Q3UFM5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nom1Q3UFM5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nom1Q3UFM5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nom1Q3UFM5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Nom1Q3UFM5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nom1Q3UFM5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nom1Q3UFM5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nom1Q3UFM5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nom1Q3UFM5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nom1Q3UFM5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nom1Q3UFM5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Nom1Q3UFM5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Nom1Q3UFM5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nom1Q3UFM5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nom1Q3UFM5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Nom1Q3UFM5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nom1Q3UFM5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nom1Q3UFM5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nom1Q3UFM5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nom1Q3UFM5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nom1Q3UFM5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nom1Q3UFM5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nom1Q3UFM5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nom1Q3UFM5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nom1Q3UFM5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nom1Q3UFM5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nom1Q3UFM5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nom1Q3UFM5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nom1Q3UFM5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nom1Q3UFM5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nom1Q3UFM5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nom1Q3UFM5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nom1Q3UFM5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nom1Q3UFM5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nom1Q3UFM5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nom1Q3UFM5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nom1Q3UFM5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nom1Q3UFM5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nom1Q3UFM5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms