Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Puf60Q3UEB3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Puf60Q3UEB3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Puf60Q3UEB3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Puf60Q3UEB3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Puf60Q3UEB3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Puf60Q3UEB3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Puf60Q3UEB3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Puf60Q3UEB3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Puf60Q3UEB3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Puf60Q3UEB3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Puf60Q3UEB3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Puf60Q3UEB3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Puf60Q3UEB3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Puf60Q3UEB3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Puf60Q3UEB3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Puf60Q3UEB3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Puf60Q3UEB3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Puf60Q3UEB3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Puf60Q3UEB3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Puf60Q3UEB3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Puf60Q3UEB3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Puf60Q3UEB3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Puf60Q3UEB3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Puf60Q3UEB3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Puf60Q3UEB3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Puf60Q3UEB3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Puf60Q3UEB3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Puf60Q3UEB3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Puf60Q3UEB3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Puf60Q3UEB3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Puf60Q3UEB3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Puf60Q3UEB3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Puf60Q3UEB3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Puf60Q3UEB3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Puf60Q3UEB3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Puf60Q3UEB3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Puf60Q3UEB3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Puf60Q3UEB3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Puf60Q3UEB3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Puf60Q3UEB3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Puf60Q3UEB3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Puf60Q3UEB3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Puf60Q3UEB3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Puf60Q3UEB3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Puf60Q3UEB3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Puf60Q3UEB3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Puf60Q3UEB3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Puf60Q3UEB3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Puf60Q3UEB3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Puf60Q3UEB3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Puf60Q3UEB3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Puf60Q3UEB3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Puf60Q3UEB3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Puf60Q3UEB3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Puf60Q3UEB3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Puf60Q3UEB3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Puf60Q3UEB3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Puf60Q3UEB3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Puf60Q3UEB3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Puf60Q3UEB3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Puf60Q3UEB3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Puf60Q3UEB3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Puf60Q3UEB3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Puf60Q3UEB3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Puf60Q3UEB3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Puf60Q3UEB3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Puf60Q3UEB3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Puf60Q3UEB3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Puf60Q3UEB3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Puf60Q3UEB3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Puf60Q3UEB3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Puf60Q3UEB3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Puf60Q3UEB3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Puf60Q3UEB3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Puf60Q3UEB3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Puf60Q3UEB3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Puf60Q3UEB3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Puf60Q3UEB3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Puf60Q3UEB3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Puf60Q3UEB3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Puf60Q3UEB3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Puf60Q3UEB3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Puf60Q3UEB3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Puf60Q3UEB3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Puf60Q3UEB3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Puf60Q3UEB3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Puf60Q3UEB3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Puf60Q3UEB3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Puf60Q3UEB3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Puf60Q3UEB3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Puf60Q3UEB3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Puf60Q3UEB3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Puf60Q3UEB3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Puf60Q3UEB3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Puf60Q3UEB3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Puf60Q3UEB3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Puf60Q3UEB3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Puf60Q3UEB3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Puf60Q3UEB3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms