Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3U7U4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3U7U4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3U7U4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3U7U4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3U7U4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3U7U4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3U7U4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3U7U4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3U7U4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3U7U4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3U7U4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3U7U4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3U7U4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3U7U4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3U7U4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3U7U4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3U7U4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3U7U4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3U7U4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3U7U4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3U7U4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3U7U4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3U7U4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3U7U4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3U7U4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3U7U4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3U7U4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3U7U4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3U7U4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3U7U4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3U7U4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3U7U4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3U7U4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3U7U4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3U7U4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3U7U4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3U7U4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3U7U4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3U7U4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3U7U4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3U7U4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3U7U4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3U7U4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3U7U4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3U7U4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3U7U4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3U7U4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3U7U4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3U7U4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3U7U4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3U7U4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3U7U4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q3U7U4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q3U7U4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q3U7U4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q3U7U4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3U7U4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3U7U4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3U7U4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3U7U4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3U7U4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3U7U4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3U7U4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Q3U7U4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3U7U4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3U7U4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3U7U4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3U7U4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q3U7U4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q3U7U4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3U7U4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3U7U4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3U7U4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3U7U4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3U7U4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3U7U4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3U7U4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3U7U4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3U7U4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3U7U4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3U7U4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3U7U4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3U7U4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3U7U4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3U7U4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3U7U4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3U7U4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3U7U4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3U7U4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3U7U4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3U7U4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3U7U4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3U7U4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3U7U4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3U7U4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3U7U4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3U7U4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3U7U4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3U7U4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms