Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6K5

Spata6, Spermatogenesis-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata6Q3U6K5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata6Q3U6K5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata6Q3U6K5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata6Q3U6K5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata6Q3U6K5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spata6Q3U6K5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spata6Q3U6K5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spata6Q3U6K5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Spata6Q3U6K5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spata6Q3U6K5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Spata6Q3U6K5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spata6Q3U6K5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Spata6Q3U6K5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Spata6Q3U6K5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Spata6Q3U6K5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spata6Q3U6K5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spata6Q3U6K5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spata6Q3U6K5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spata6Q3U6K5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spata6Q3U6K5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spata6Q3U6K5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spata6Q3U6K5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spata6Q3U6K5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spata6Q3U6K5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Spata6Q3U6K5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spata6Q3U6K5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spata6Q3U6K5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spata6Q3U6K5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spata6Q3U6K5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spata6Q3U6K5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spata6Q3U6K5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spata6Q3U6K5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spata6Q3U6K5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spata6Q3U6K5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spata6Q3U6K5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spata6Q3U6K5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spata6Q3U6K5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spata6Q3U6K5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spata6Q3U6K5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spata6Q3U6K5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spata6Q3U6K5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Spata6Q3U6K5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spata6Q3U6K5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spata6Q3U6K5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spata6Q3U6K5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spata6Q3U6K5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spata6Q3U6K5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spata6Q3U6K5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spata6Q3U6K5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spata6Q3U6K5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spata6Q3U6K5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spata6Q3U6K5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spata6Q3U6K5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spata6Q3U6K5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spata6Q3U6K5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spata6Q3U6K5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spata6Q3U6K5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spata6Q3U6K5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Spata6Q3U6K5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spata6Q3U6K5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Spata6Q3U6K5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spata6Q3U6K5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spata6Q3U6K5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spata6Q3U6K5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spata6Q3U6K5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spata6Q3U6K5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spata6Q3U6K5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spata6Q3U6K5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spata6Q3U6K5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms