Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3R4

Lmf1, Lipase maturation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmf1Q3U3R4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmf1Q3U3R4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmf1Q3U3R4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmf1Q3U3R4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmf1Q3U3R4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmf1Q3U3R4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmf1Q3U3R4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmf1Q3U3R4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmf1Q3U3R4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmf1Q3U3R4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmf1Q3U3R4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmf1Q3U3R4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmf1Q3U3R4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmf1Q3U3R4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmf1Q3U3R4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmf1Q3U3R4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmf1Q3U3R4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmf1Q3U3R4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmf1Q3U3R4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmf1Q3U3R4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmf1Q3U3R4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmf1Q3U3R4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmf1Q3U3R4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmf1Q3U3R4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmf1Q3U3R4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmf1Q3U3R4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmf1Q3U3R4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmf1Q3U3R4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmf1Q3U3R4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmf1Q3U3R4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmf1Q3U3R4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmf1Q3U3R4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmf1Q3U3R4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmf1Q3U3R4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmf1Q3U3R4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmf1Q3U3R4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmf1Q3U3R4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmf1Q3U3R4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmf1Q3U3R4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmf1Q3U3R4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmf1Q3U3R4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmf1Q3U3R4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmf1Q3U3R4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmf1Q3U3R4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmf1Q3U3R4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmf1Q3U3R4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmf1Q3U3R4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmf1Q3U3R4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmf1Q3U3R4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmf1Q3U3R4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmf1Q3U3R4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmf1Q3U3R4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmf1Q3U3R4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmf1Q3U3R4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmf1Q3U3R4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmf1Q3U3R4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmf1Q3U3R4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmf1Q3U3R4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmf1Q3U3R4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmf1Q3U3R4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lmf1Q3U3R4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmf1Q3U3R4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmf1Q3U3R4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmf1Q3U3R4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmf1Q3U3R4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmf1Q3U3R4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmf1Q3U3R4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmf1Q3U3R4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmf1Q3U3R4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmf1Q3U3R4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmf1Q3U3R4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmf1Q3U3R4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmf1Q3U3R4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmf1Q3U3R4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmf1Q3U3R4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmf1Q3U3R4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmf1Q3U3R4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmf1Q3U3R4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmf1Q3U3R4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmf1Q3U3R4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmf1Q3U3R4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmf1Q3U3R4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmf1Q3U3R4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmf1Q3U3R4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmf1Q3U3R4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lmf1Q3U3R4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmf1Q3U3R4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmf1Q3U3R4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmf1Q3U3R4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmf1Q3U3R4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmf1Q3U3R4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmf1Q3U3R4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmf1Q3U3R4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmf1Q3U3R4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmf1Q3U3R4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmf1Q3U3R4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmf1Q3U3R4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmf1Q3U3R4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmf1Q3U3R4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmf1Q3U3R4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms