Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec24aQ3U2P1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec24aQ3U2P1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec24aQ3U2P1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec24aQ3U2P1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec24aQ3U2P1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec24aQ3U2P1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec24aQ3U2P1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec24aQ3U2P1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec24aQ3U2P1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec24aQ3U2P1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec24aQ3U2P1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec24aQ3U2P1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec24aQ3U2P1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec24aQ3U2P1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec24aQ3U2P1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec24aQ3U2P1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sec24aQ3U2P1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sec24aQ3U2P1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sec24aQ3U2P1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sec24aQ3U2P1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec24aQ3U2P1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec24aQ3U2P1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec24aQ3U2P1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec24aQ3U2P1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec24aQ3U2P1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec24aQ3U2P1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec24aQ3U2P1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec24aQ3U2P1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec24aQ3U2P1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec24aQ3U2P1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec24aQ3U2P1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sec24aQ3U2P1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sec24aQ3U2P1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec24aQ3U2P1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec24aQ3U2P1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec24aQ3U2P1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec24aQ3U2P1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec24aQ3U2P1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec24aQ3U2P1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec24aQ3U2P1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sec24aQ3U2P1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sec24aQ3U2P1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sec24aQ3U2P1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sec24aQ3U2P1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sec24aQ3U2P1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sec24aQ3U2P1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sec24aQ3U2P1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec24aQ3U2P1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec24aQ3U2P1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec24aQ3U2P1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec24aQ3U2P1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec24aQ3U2P1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec24aQ3U2P1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec24aQ3U2P1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec24aQ3U2P1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec24aQ3U2P1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec24aQ3U2P1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec24aQ3U2P1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec24aQ3U2P1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec24aQ3U2P1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec24aQ3U2P1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec24aQ3U2P1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec24aQ3U2P1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sec24aQ3U2P1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec24aQ3U2P1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sec24aQ3U2P1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms