Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Serac1Q3U213 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Serac1Q3U213 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Serac1Q3U213 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Serac1Q3U213 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Serac1Q3U213 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Serac1Q3U213 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Serac1Q3U213 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Serac1Q3U213 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Serac1Q3U213 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Serac1Q3U213 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Serac1Q3U213 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Serac1Q3U213 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Serac1Q3U213 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Serac1Q3U213 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Serac1Q3U213 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Serac1Q3U213 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Serac1Q3U213 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Serac1Q3U213 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Serac1Q3U213 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Serac1Q3U213 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Serac1Q3U213 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Serac1Q3U213 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Serac1Q3U213 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Serac1Q3U213 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Serac1Q3U213 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Serac1Q3U213 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Serac1Q3U213 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Serac1Q3U213 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Serac1Q3U213 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Serac1Q3U213 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Serac1Q3U213 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Serac1Q3U213 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Serac1Q3U213 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Serac1Q3U213 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Serac1Q3U213 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Serac1Q3U213 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Serac1Q3U213 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Serac1Q3U213 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Serac1Q3U213 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Serac1Q3U213 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Serac1Q3U213 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Serac1Q3U213 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Serac1Q3U213 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Serac1Q3U213 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Serac1Q3U213 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Serac1Q3U213 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Serac1Q3U213 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Serac1Q3U213 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Serac1Q3U213 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Serac1Q3U213 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Serac1Q3U213 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Serac1Q3U213 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Serac1Q3U213 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Serac1Q3U213 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Serac1Q3U213 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Serac1Q3U213 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Serac1Q3U213 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Serac1Q3U213 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Serac1Q3U213 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Serac1Q3U213 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Serac1Q3U213 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Serac1Q3U213 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Serac1Q3U213 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Serac1Q3U213 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Serac1Q3U213 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Serac1Q3U213 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Serac1Q3U213 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Serac1Q3U213 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Serac1Q3U213 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Serac1Q3U213 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Serac1Q3U213 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Serac1Q3U213 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Serac1Q3U213 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Serac1Q3U213 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Serac1Q3U213 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Serac1Q3U213 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Serac1Q3U213 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Serac1Q3U213 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Serac1Q3U213 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Serac1Q3U213 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Serac1Q3U213 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Serac1Q3U213 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Serac1Q3U213 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Serac1Q3U213 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Serac1Q3U213 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Serac1Q3U213 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Serac1Q3U213 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Serac1Q3U213 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Serac1Q3U213 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Serac1Q3U213 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Serac1Q3U213 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Serac1Q3U213 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Serac1Q3U213 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Serac1Q3U213 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Serac1Q3U213 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Serac1Q3U213 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Serac1Q3U213 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Serac1Q3U213 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Serac1Q3U213 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms