Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0I6

Smim6, MCG148180, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim6Q3U0I6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,94■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,94■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17,94■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,94■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17,94■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17,94■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17,93■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,93■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,93■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,93■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,92■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,92■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,92■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,92■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,92■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,92■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17,92■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17,92■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,92■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,91■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17,91■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,91■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17,9■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,9■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,9■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17,9■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17,9■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17,9■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17,9■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17,89■□□□□ 0,46
Smim6Q3U0I6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,89■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,89■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,89■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,89■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,89■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,89■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17,88■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17,88■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17,88■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,88■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17,88■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,88■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,87■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,87■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17,87■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17,87■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,87■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17,87■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,87■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,86■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,86■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,85■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17,85■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,84■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,84■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17,84■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17,83■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17,83■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17,83■□□□□ 0,45
Smim6Q3U0I6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17,83■□□□□ 0,44
Smim6Q3U0I6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,83■□□□□ 0,44
Smim6Q3U0I6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17,83■□□□□ 0,44
Smim6Q3U0I6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,82■□□□□ 0,44
Smim6Q3U0I6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
Smim6Q3U0I6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
Smim6Q3U0I6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
Smim6Q3U0I6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,82■□□□□ 0,44
Smim6Q3U0I6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
Smim6Q3U0I6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17,82■□□□□ 0,44
Smim6Q3U0I6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
Smim6Q3U0I6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
Smim6Q3U0I6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,82■□□□□ 0,44
Smim6Q3U0I6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
Smim6Q3U0I6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,81■□□□□ 0,44
Smim6Q3U0I6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,81■□□□□ 0,44
Smim6Q3U0I6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,81■□□□□ 0,44
Smim6Q3U0I6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17,81■□□□□ 0,44
Smim6Q3U0I6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,8■□□□□ 0,44
Smim6Q3U0I6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,8■□□□□ 0,44
Smim6Q3U0I6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,8■□□□□ 0,44
Smim6Q3U0I6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,79■□□□□ 0,44
Smim6Q3U0I6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17,79■□□□□ 0,44
Smim6Q3U0I6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,79■□□□□ 0,44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,8 ms