Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hace1Q3U0D9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hace1Q3U0D9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hace1Q3U0D9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hace1Q3U0D9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hace1Q3U0D9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hace1Q3U0D9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Hace1Q3U0D9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hace1Q3U0D9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hace1Q3U0D9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hace1Q3U0D9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hace1Q3U0D9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hace1Q3U0D9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Hace1Q3U0D9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hace1Q3U0D9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hace1Q3U0D9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hace1Q3U0D9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hace1Q3U0D9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hace1Q3U0D9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hace1Q3U0D9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Hace1Q3U0D9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hace1Q3U0D9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hace1Q3U0D9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hace1Q3U0D9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Hace1Q3U0D9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Hace1Q3U0D9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hace1Q3U0D9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hace1Q3U0D9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hace1Q3U0D9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hace1Q3U0D9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Hace1Q3U0D9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hace1Q3U0D9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hace1Q3U0D9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hace1Q3U0D9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hace1Q3U0D9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hace1Q3U0D9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Hace1Q3U0D9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hace1Q3U0D9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Hace1Q3U0D9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hace1Q3U0D9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hace1Q3U0D9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hace1Q3U0D9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hace1Q3U0D9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hace1Q3U0D9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hace1Q3U0D9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hace1Q3U0D9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hace1Q3U0D9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hace1Q3U0D9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hace1Q3U0D9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hace1Q3U0D9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hace1Q3U0D9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hace1Q3U0D9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Hace1Q3U0D9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hace1Q3U0D9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hace1Q3U0D9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hace1Q3U0D9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hace1Q3U0D9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hace1Q3U0D9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hace1Q3U0D9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hace1Q3U0D9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hace1Q3U0D9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hace1Q3U0D9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hace1Q3U0D9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hace1Q3U0D9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hace1Q3U0D9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hace1Q3U0D9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Hace1Q3U0D9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hace1Q3U0D9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hace1Q3U0D9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hace1Q3U0D9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hace1Q3U0D9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hace1Q3U0D9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hace1Q3U0D9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hace1Q3U0D9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Hace1Q3U0D9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hace1Q3U0D9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hace1Q3U0D9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hace1Q3U0D9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hace1Q3U0D9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hace1Q3U0D9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Hace1Q3U0D9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hace1Q3U0D9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hace1Q3U0D9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hace1Q3U0D9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hace1Q3U0D9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hace1Q3U0D9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hace1Q3U0D9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hace1Q3U0D9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hace1Q3U0D9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hace1Q3U0D9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms