Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rufy4Q3TYX8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rufy4Q3TYX8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rufy4Q3TYX8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rufy4Q3TYX8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rufy4Q3TYX8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rufy4Q3TYX8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rufy4Q3TYX8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rufy4Q3TYX8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rufy4Q3TYX8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rufy4Q3TYX8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rufy4Q3TYX8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rufy4Q3TYX8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rufy4Q3TYX8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rufy4Q3TYX8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Rufy4Q3TYX8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rufy4Q3TYX8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rufy4Q3TYX8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rufy4Q3TYX8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Rufy4Q3TYX8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rufy4Q3TYX8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rufy4Q3TYX8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rufy4Q3TYX8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rufy4Q3TYX8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rufy4Q3TYX8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rufy4Q3TYX8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rufy4Q3TYX8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rufy4Q3TYX8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rufy4Q3TYX8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rufy4Q3TYX8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rufy4Q3TYX8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rufy4Q3TYX8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Rufy4Q3TYX8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rufy4Q3TYX8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rufy4Q3TYX8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rufy4Q3TYX8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rufy4Q3TYX8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rufy4Q3TYX8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rufy4Q3TYX8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rufy4Q3TYX8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rufy4Q3TYX8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rufy4Q3TYX8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rufy4Q3TYX8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rufy4Q3TYX8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rufy4Q3TYX8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Rufy4Q3TYX8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rufy4Q3TYX8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rufy4Q3TYX8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rufy4Q3TYX8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rufy4Q3TYX8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rufy4Q3TYX8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rufy4Q3TYX8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rufy4Q3TYX8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rufy4Q3TYX8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rufy4Q3TYX8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rufy4Q3TYX8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rufy4Q3TYX8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rufy4Q3TYX8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rufy4Q3TYX8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rufy4Q3TYX8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rufy4Q3TYX8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rufy4Q3TYX8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rufy4Q3TYX8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rufy4Q3TYX8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rufy4Q3TYX8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rufy4Q3TYX8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rufy4Q3TYX8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rufy4Q3TYX8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms