Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hhla1Q3TYV2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hhla1Q3TYV2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hhla1Q3TYV2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hhla1Q3TYV2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hhla1Q3TYV2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hhla1Q3TYV2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hhla1Q3TYV2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hhla1Q3TYV2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hhla1Q3TYV2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hhla1Q3TYV2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hhla1Q3TYV2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hhla1Q3TYV2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hhla1Q3TYV2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hhla1Q3TYV2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Hhla1Q3TYV2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Hhla1Q3TYV2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hhla1Q3TYV2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hhla1Q3TYV2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hhla1Q3TYV2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hhla1Q3TYV2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hhla1Q3TYV2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hhla1Q3TYV2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hhla1Q3TYV2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hhla1Q3TYV2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hhla1Q3TYV2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hhla1Q3TYV2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hhla1Q3TYV2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hhla1Q3TYV2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hhla1Q3TYV2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hhla1Q3TYV2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Hhla1Q3TYV2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hhla1Q3TYV2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hhla1Q3TYV2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hhla1Q3TYV2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hhla1Q3TYV2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Hhla1Q3TYV2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hhla1Q3TYV2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Hhla1Q3TYV2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hhla1Q3TYV2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hhla1Q3TYV2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hhla1Q3TYV2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hhla1Q3TYV2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hhla1Q3TYV2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hhla1Q3TYV2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hhla1Q3TYV2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Hhla1Q3TYV2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hhla1Q3TYV2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hhla1Q3TYV2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hhla1Q3TYV2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hhla1Q3TYV2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hhla1Q3TYV2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hhla1Q3TYV2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hhla1Q3TYV2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hhla1Q3TYV2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Hhla1Q3TYV2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hhla1Q3TYV2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hhla1Q3TYV2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hhla1Q3TYV2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hhla1Q3TYV2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hhla1Q3TYV2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hhla1Q3TYV2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hhla1Q3TYV2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hhla1Q3TYV2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hhla1Q3TYV2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hhla1Q3TYV2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hhla1Q3TYV2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hhla1Q3TYV2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hhla1Q3TYV2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hhla1Q3TYV2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hhla1Q3TYV2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hhla1Q3TYV2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hhla1Q3TYV2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hhla1Q3TYV2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hhla1Q3TYV2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hhla1Q3TYV2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hhla1Q3TYV2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hhla1Q3TYV2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hhla1Q3TYV2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hhla1Q3TYV2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hhla1Q3TYV2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hhla1Q3TYV2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hhla1Q3TYV2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hhla1Q3TYV2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hhla1Q3TYV2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hhla1Q3TYV2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hhla1Q3TYV2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hhla1Q3TYV2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hhla1Q3TYV2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Hhla1Q3TYV2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hhla1Q3TYV2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hhla1Q3TYV2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hhla1Q3TYV2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hhla1Q3TYV2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hhla1Q3TYV2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hhla1Q3TYV2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Hhla1Q3TYV2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hhla1Q3TYV2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hhla1Q3TYV2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hhla1Q3TYV2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms