Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Pbxip1Q3TVI8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pbxip1Q3TVI8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pbxip1Q3TVI8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pbxip1Q3TVI8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pbxip1Q3TVI8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pbxip1Q3TVI8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Pbxip1Q3TVI8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pbxip1Q3TVI8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pbxip1Q3TVI8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pbxip1Q3TVI8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pbxip1Q3TVI8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pbxip1Q3TVI8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Pbxip1Q3TVI8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pbxip1Q3TVI8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pbxip1Q3TVI8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pbxip1Q3TVI8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pbxip1Q3TVI8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pbxip1Q3TVI8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pbxip1Q3TVI8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pbxip1Q3TVI8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pbxip1Q3TVI8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pbxip1Q3TVI8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pbxip1Q3TVI8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pbxip1Q3TVI8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pbxip1Q3TVI8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pbxip1Q3TVI8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pbxip1Q3TVI8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pbxip1Q3TVI8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pbxip1Q3TVI8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Pbxip1Q3TVI8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pbxip1Q3TVI8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pbxip1Q3TVI8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pbxip1Q3TVI8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pbxip1Q3TVI8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pbxip1Q3TVI8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pbxip1Q3TVI8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pbxip1Q3TVI8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pbxip1Q3TVI8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pbxip1Q3TVI8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pbxip1Q3TVI8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pbxip1Q3TVI8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pbxip1Q3TVI8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Pbxip1Q3TVI8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pbxip1Q3TVI8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Pbxip1Q3TVI8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pbxip1Q3TVI8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pbxip1Q3TVI8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Pbxip1Q3TVI8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pbxip1Q3TVI8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pbxip1Q3TVI8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pbxip1Q3TVI8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pbxip1Q3TVI8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pbxip1Q3TVI8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pbxip1Q3TVI8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pbxip1Q3TVI8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pbxip1Q3TVI8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pbxip1Q3TVI8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pbxip1Q3TVI8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pbxip1Q3TVI8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pbxip1Q3TVI8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pbxip1Q3TVI8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pbxip1Q3TVI8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pbxip1Q3TVI8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pbxip1Q3TVI8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pbxip1Q3TVI8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pbxip1Q3TVI8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pbxip1Q3TVI8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Pbxip1Q3TVI8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pbxip1Q3TVI8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pbxip1Q3TVI8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pbxip1Q3TVI8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pbxip1Q3TVI8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pbxip1Q3TVI8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pbxip1Q3TVI8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pbxip1Q3TVI8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pbxip1Q3TVI8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pbxip1Q3TVI8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pbxip1Q3TVI8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pbxip1Q3TVI8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pbxip1Q3TVI8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pbxip1Q3TVI8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pbxip1Q3TVI8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Pbxip1Q3TVI8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pbxip1Q3TVI8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pbxip1Q3TVI8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pbxip1Q3TVI8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pbxip1Q3TVI8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pbxip1Q3TVI8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Pbxip1Q3TVI8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pbxip1Q3TVI8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pbxip1Q3TVI8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pbxip1Q3TVI8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pbxip1Q3TVI8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pbxip1Q3TVI8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pbxip1Q3TVI8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pbxip1Q3TVI8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pbxip1Q3TVI8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pbxip1Q3TVI8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pbxip1Q3TVI8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms