Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS87

9130409I23Rik, MCG19844, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9130409I23RikQ3TS87 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
9130409I23RikQ3TS87 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
9130409I23RikQ3TS87 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
9130409I23RikQ3TS87 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
9130409I23RikQ3TS87 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
9130409I23RikQ3TS87 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
9130409I23RikQ3TS87 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
9130409I23RikQ3TS87 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
9130409I23RikQ3TS87 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
9130409I23RikQ3TS87 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
9130409I23RikQ3TS87 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
9130409I23RikQ3TS87 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
9130409I23RikQ3TS87 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
9130409I23RikQ3TS87 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
9130409I23RikQ3TS87 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
9130409I23RikQ3TS87 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
9130409I23RikQ3TS87 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
9130409I23RikQ3TS87 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
9130409I23RikQ3TS87 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
9130409I23RikQ3TS87 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
9130409I23RikQ3TS87 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
9130409I23RikQ3TS87 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
9130409I23RikQ3TS87 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
9130409I23RikQ3TS87 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
9130409I23RikQ3TS87 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
9130409I23RikQ3TS87 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
9130409I23RikQ3TS87 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
9130409I23RikQ3TS87 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
9130409I23RikQ3TS87 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
9130409I23RikQ3TS87 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
9130409I23RikQ3TS87 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
9130409I23RikQ3TS87 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
9130409I23RikQ3TS87 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
9130409I23RikQ3TS87 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
9130409I23RikQ3TS87 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
9130409I23RikQ3TS87 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
9130409I23RikQ3TS87 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
9130409I23RikQ3TS87 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
9130409I23RikQ3TS87 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
9130409I23RikQ3TS87 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
9130409I23RikQ3TS87 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
9130409I23RikQ3TS87 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
9130409I23RikQ3TS87 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
9130409I23RikQ3TS87 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
9130409I23RikQ3TS87 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
9130409I23RikQ3TS87 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
9130409I23RikQ3TS87 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
9130409I23RikQ3TS87 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
9130409I23RikQ3TS87 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
9130409I23RikQ3TS87 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
9130409I23RikQ3TS87 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
9130409I23RikQ3TS87 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
9130409I23RikQ3TS87 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
9130409I23RikQ3TS87 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
9130409I23RikQ3TS87 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
9130409I23RikQ3TS87 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
9130409I23RikQ3TS87 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
9130409I23RikQ3TS87 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
9130409I23RikQ3TS87 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
9130409I23RikQ3TS87 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
9130409I23RikQ3TS87 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
9130409I23RikQ3TS87 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
9130409I23RikQ3TS87 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
9130409I23RikQ3TS87 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms