Protein–RNA interactions for Protein: Q307W7

Kncn, Kinocilin, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KncnQ307W7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KncnQ307W7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KncnQ307W7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KncnQ307W7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KncnQ307W7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KncnQ307W7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KncnQ307W7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KncnQ307W7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KncnQ307W7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KncnQ307W7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KncnQ307W7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KncnQ307W7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KncnQ307W7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms