Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdgfl1Q2VPR5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdgfl1Q2VPR5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdgfl1Q2VPR5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdgfl1Q2VPR5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdgfl1Q2VPR5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdgfl1Q2VPR5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdgfl1Q2VPR5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdgfl1Q2VPR5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdgfl1Q2VPR5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdgfl1Q2VPR5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdgfl1Q2VPR5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdgfl1Q2VPR5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdgfl1Q2VPR5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdgfl1Q2VPR5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdgfl1Q2VPR5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdgfl1Q2VPR5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdgfl1Q2VPR5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdgfl1Q2VPR5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdgfl1Q2VPR5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdgfl1Q2VPR5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdgfl1Q2VPR5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdgfl1Q2VPR5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdgfl1Q2VPR5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdgfl1Q2VPR5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdgfl1Q2VPR5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdgfl1Q2VPR5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdgfl1Q2VPR5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdgfl1Q2VPR5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdgfl1Q2VPR5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdgfl1Q2VPR5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdgfl1Q2VPR5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdgfl1Q2VPR5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdgfl1Q2VPR5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdgfl1Q2VPR5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdgfl1Q2VPR5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdgfl1Q2VPR5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdgfl1Q2VPR5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdgfl1Q2VPR5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdgfl1Q2VPR5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdgfl1Q2VPR5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdgfl1Q2VPR5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdgfl1Q2VPR5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdgfl1Q2VPR5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdgfl1Q2VPR5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdgfl1Q2VPR5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdgfl1Q2VPR5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdgfl1Q2VPR5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdgfl1Q2VPR5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdgfl1Q2VPR5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdgfl1Q2VPR5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdgfl1Q2VPR5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdgfl1Q2VPR5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdgfl1Q2VPR5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdgfl1Q2VPR5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdgfl1Q2VPR5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdgfl1Q2VPR5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdgfl1Q2VPR5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdgfl1Q2VPR5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdgfl1Q2VPR5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdgfl1Q2VPR5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdgfl1Q2VPR5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdgfl1Q2VPR5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdgfl1Q2VPR5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdgfl1Q2VPR5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdgfl1Q2VPR5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdgfl1Q2VPR5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdgfl1Q2VPR5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdgfl1Q2VPR5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdgfl1Q2VPR5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdgfl1Q2VPR5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdgfl1Q2VPR5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdgfl1Q2VPR5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdgfl1Q2VPR5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdgfl1Q2VPR5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdgfl1Q2VPR5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdgfl1Q2VPR5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdgfl1Q2VPR5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdgfl1Q2VPR5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdgfl1Q2VPR5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdgfl1Q2VPR5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdgfl1Q2VPR5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdgfl1Q2VPR5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdgfl1Q2VPR5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdgfl1Q2VPR5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdgfl1Q2VPR5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdgfl1Q2VPR5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdgfl1Q2VPR5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdgfl1Q2VPR5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdgfl1Q2VPR5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdgfl1Q2VPR5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdgfl1Q2VPR5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdgfl1Q2VPR5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdgfl1Q2VPR5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdgfl1Q2VPR5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms