Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cers3Q1A3B0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cers3Q1A3B0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cers3Q1A3B0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cers3Q1A3B0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cers3Q1A3B0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cers3Q1A3B0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cers3Q1A3B0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cers3Q1A3B0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cers3Q1A3B0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Cers3Q1A3B0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cers3Q1A3B0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cers3Q1A3B0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cers3Q1A3B0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cers3Q1A3B0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cers3Q1A3B0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cers3Q1A3B0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cers3Q1A3B0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cers3Q1A3B0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Cers3Q1A3B0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cers3Q1A3B0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cers3Q1A3B0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cers3Q1A3B0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cers3Q1A3B0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cers3Q1A3B0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cers3Q1A3B0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cers3Q1A3B0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cers3Q1A3B0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cers3Q1A3B0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cers3Q1A3B0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cers3Q1A3B0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cers3Q1A3B0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cers3Q1A3B0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cers3Q1A3B0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cers3Q1A3B0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cers3Q1A3B0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cers3Q1A3B0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cers3Q1A3B0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Cers3Q1A3B0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cers3Q1A3B0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cers3Q1A3B0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cers3Q1A3B0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cers3Q1A3B0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cers3Q1A3B0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cers3Q1A3B0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cers3Q1A3B0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Cers3Q1A3B0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cers3Q1A3B0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cers3Q1A3B0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cers3Q1A3B0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cers3Q1A3B0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cers3Q1A3B0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cers3Q1A3B0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cers3Q1A3B0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cers3Q1A3B0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cers3Q1A3B0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cers3Q1A3B0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cers3Q1A3B0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Cers3Q1A3B0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cers3Q1A3B0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cers3Q1A3B0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cers3Q1A3B0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cers3Q1A3B0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cers3Q1A3B0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cers3Q1A3B0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cers3Q1A3B0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cers3Q1A3B0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cers3Q1A3B0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cers3Q1A3B0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cers3Q1A3B0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cers3Q1A3B0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cers3Q1A3B0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cers3Q1A3B0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cers3Q1A3B0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cers3Q1A3B0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Cers3Q1A3B0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cers3Q1A3B0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Cers3Q1A3B0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cers3Q1A3B0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Cers3Q1A3B0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cers3Q1A3B0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cers3Q1A3B0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cers3Q1A3B0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cers3Q1A3B0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cers3Q1A3B0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cers3Q1A3B0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cers3Q1A3B0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cers3Q1A3B0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cers3Q1A3B0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cers3Q1A3B0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cers3Q1A3B0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cers3Q1A3B0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cers3Q1A3B0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cers3Q1A3B0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Cers3Q1A3B0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cers3Q1A3B0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cers3Q1A3B0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cers3Q1A3B0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cers3Q1A3B0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cers3Q1A3B0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms