Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rpusd2Q149F1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rpusd2Q149F1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rpusd2Q149F1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rpusd2Q149F1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rpusd2Q149F1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rpusd2Q149F1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rpusd2Q149F1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rpusd2Q149F1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rpusd2Q149F1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rpusd2Q149F1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rpusd2Q149F1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rpusd2Q149F1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rpusd2Q149F1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Rpusd2Q149F1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rpusd2Q149F1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpusd2Q149F1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpusd2Q149F1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpusd2Q149F1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpusd2Q149F1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpusd2Q149F1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpusd2Q149F1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rpusd2Q149F1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rpusd2Q149F1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rpusd2Q149F1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rpusd2Q149F1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rpusd2Q149F1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rpusd2Q149F1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rpusd2Q149F1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rpusd2Q149F1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rpusd2Q149F1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rpusd2Q149F1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rpusd2Q149F1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rpusd2Q149F1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Rpusd2Q149F1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rpusd2Q149F1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rpusd2Q149F1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rpusd2Q149F1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rpusd2Q149F1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rpusd2Q149F1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rpusd2Q149F1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rpusd2Q149F1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rpusd2Q149F1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rpusd2Q149F1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rpusd2Q149F1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Rpusd2Q149F1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rpusd2Q149F1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rpusd2Q149F1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rpusd2Q149F1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rpusd2Q149F1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rpusd2Q149F1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rpusd2Q149F1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rpusd2Q149F1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rpusd2Q149F1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rpusd2Q149F1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Rpusd2Q149F1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rpusd2Q149F1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rpusd2Q149F1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rpusd2Q149F1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rpusd2Q149F1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rpusd2Q149F1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rpusd2Q149F1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rpusd2Q149F1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rpusd2Q149F1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rpusd2Q149F1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rpusd2Q149F1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rpusd2Q149F1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Rpusd2Q149F1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rpusd2Q149F1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rpusd2Q149F1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rpusd2Q149F1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rpusd2Q149F1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Rpusd2Q149F1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpusd2Q149F1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpusd2Q149F1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rpusd2Q149F1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rpusd2Q149F1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rpusd2Q149F1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rpusd2Q149F1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpusd2Q149F1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpusd2Q149F1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Rpusd2Q149F1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rpusd2Q149F1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Rpusd2Q149F1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rpusd2Q149F1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpusd2Q149F1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpusd2Q149F1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpusd2Q149F1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpusd2Q149F1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rpusd2Q149F1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rpusd2Q149F1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rpusd2Q149F1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rpusd2Q149F1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rpusd2Q149F1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rpusd2Q149F1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rpusd2Q149F1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rpusd2Q149F1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Rpusd2Q149F1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rpusd2Q149F1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rpusd2Q149F1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
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