Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtel1Q0VGM9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtel1Q0VGM9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtel1Q0VGM9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rtel1Q0VGM9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rtel1Q0VGM9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtel1Q0VGM9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtel1Q0VGM9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtel1Q0VGM9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtel1Q0VGM9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtel1Q0VGM9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtel1Q0VGM9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtel1Q0VGM9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtel1Q0VGM9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtel1Q0VGM9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtel1Q0VGM9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtel1Q0VGM9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtel1Q0VGM9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtel1Q0VGM9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtel1Q0VGM9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtel1Q0VGM9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtel1Q0VGM9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtel1Q0VGM9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtel1Q0VGM9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtel1Q0VGM9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtel1Q0VGM9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtel1Q0VGM9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtel1Q0VGM9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtel1Q0VGM9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtel1Q0VGM9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtel1Q0VGM9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtel1Q0VGM9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtel1Q0VGM9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtel1Q0VGM9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtel1Q0VGM9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtel1Q0VGM9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtel1Q0VGM9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtel1Q0VGM9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtel1Q0VGM9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtel1Q0VGM9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtel1Q0VGM9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtel1Q0VGM9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtel1Q0VGM9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtel1Q0VGM9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtel1Q0VGM9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtel1Q0VGM9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtel1Q0VGM9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtel1Q0VGM9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtel1Q0VGM9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtel1Q0VGM9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtel1Q0VGM9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtel1Q0VGM9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtel1Q0VGM9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtel1Q0VGM9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtel1Q0VGM9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtel1Q0VGM9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtel1Q0VGM9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtel1Q0VGM9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtel1Q0VGM9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtel1Q0VGM9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtel1Q0VGM9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtel1Q0VGM9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtel1Q0VGM9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtel1Q0VGM9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtel1Q0VGM9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtel1Q0VGM9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtel1Q0VGM9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtel1Q0VGM9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtel1Q0VGM9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtel1Q0VGM9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtel1Q0VGM9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtel1Q0VGM9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtel1Q0VGM9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtel1Q0VGM9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtel1Q0VGM9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtel1Q0VGM9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtel1Q0VGM9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtel1Q0VGM9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtel1Q0VGM9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtel1Q0VGM9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtel1Q0VGM9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtel1Q0VGM9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtel1Q0VGM9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtel1Q0VGM9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtel1Q0VGM9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rtel1Q0VGM9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rtel1Q0VGM9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rtel1Q0VGM9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtel1Q0VGM9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtel1Q0VGM9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtel1Q0VGM9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtel1Q0VGM9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtel1Q0VGM9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtel1Q0VGM9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtel1Q0VGM9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtel1Q0VGM9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtel1Q0VGM9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtel1Q0VGM9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtel1Q0VGM9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtel1Q0VGM9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms